代建委托协议是否应该和主管部门签，取决于具体的代建项目情况、相关法律法规以及合同双方的约定。以下是对这一问题的详细分析：
代建项目的性质：
- 如果代建项目是由政府投资或主导，且主管部门作为项目的发起者或管理者，那么与主管部门签订代建委托协议是合理的，以确保项目的合法性和合规性。
- 如果代建项目是由企业或个人投资，且主管部门并非项目的直接参与者或管理者，那么代建委托协议可能更适合与项目的实际投资者或开发者签订。
相关法律法规的规定：
- 根据不同的地区和行业，代建项目的法律法规可能有所不同。在某些情况下，法律可能明确规定代建委托协议必须与主管部门签订，以确保项目的监管和审批。
- 在其他情况下，法律可能允许代建委托协议由合同双方自由协商签订，而不强制要求与主管部门签订。
合同双方的约定：
- 代建委托协议是合同双方（即代建方和委托方）之间的法律文件，用于明确双方的权利和义务。因此，协议的具体内容应由双方根据项目的实际情况和法律法规进行协商和约定。
- 如果双方同意与主管部门签订代建委托协议，并且主管部门也同意作为协议的一方，那么这种做法是可行的。
- 如果双方认为与主管部门签订协议不是必要的，或者主管部门不愿意作为协议的一方，那么代建委托协议可以在双方之间签订，而无需主管部门参与。
综上所述，代建委托协议是否应该和主管部门签，需要根据具体的代建项目情况、相关法律法规以及合同双方的约定来确定。在实际操作中，建议双方充分沟通并协商，确保协议的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。