原配无法直接通过起诉“小三”的方式使其留案底，但可以通过特定法律途径追究其责任，若构成犯罪或违反治安管理，则可能留下案底。以下从不同角度详细分析：

1. 民事侵权角度：

   • 若“小三”的行为侵犯了原配的合法权益，如侵犯名誉权、隐私权等，原配可以提起民事诉讼，要求“小三”停止侵害、赔礼道歉、赔偿损失等。但单纯的民事诉讼判决不会使“小三”留案底，因为民事案件的记录通常不会作为犯罪记录或违法记录留存。

2. 刑事犯罪角度：

   • 如果“小三”的行为构成了犯罪，如重婚罪（若与已婚者以夫妻名义共同生活）、侮辱罪（若公开侮辱原配）、诽谤罪（若捏造事实诽谤原配）等，原配可以向公安机关报案，由公安机关立案侦查。若经法院审理后认定“小三”构成犯罪，则会留下犯罪记录，即通常所说的“案底”。
   • 需要注意的是，重婚罪的认定较为严格，通常要求“小三”与已婚者以夫妻名义共同生活，且周围群众也认为他们是夫妻关系。若仅是偶尔的通奸或婚外情，一般不构成重婚罪。

3. 治安管理处罚角度：

   • 若“小三”的行为违反了治安管理处罚法，如公然侮辱他人、捏造事实诽谤他人等，但尚未构成犯罪，公安机关可以对其处以行政拘留、罚款等处罚。这种处罚记录虽然不属于犯罪记录，但也会在一定范围内留存，可能对“小三”的声誉和信用产生一定影响。不过，这种记录通常不被严格称为“案底”，而是治安管理处罚记录。

建议：

• 原配在发现“小三”的行为后，应首先收集证据，如聊天记录、照片、视频等，以证明“小三”的违法行为或侵权行为。
• 若认为“小三”的行为可能构成犯罪，应及时向公安机关报案，并配合公安机关的调查工作。
• 若认为“小三”的行为侵犯了自己的民事权益，可以咨询专业律师，考虑提起民事诉讼以维护自己的合法权益。

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