结论前置：便利店烟被查且留了店员信息，是否对店员有影响需分情况讨论，主要取决于店员是否涉及违法行为及具体行为性质。以下从不同角度详细分析：

一、若店员未参与违法行为

1. 法律责任层面：若店员仅作为普通员工，未参与便利店销售非法来源香烟、未协助实施违法行为（如伪造进货凭证、逃避检查等），则其个人无需承担法律责任。行政机关或司法机关留存信息主要用于调查便利店整体违法行为，不会单独追究店员责任。
2. 实际影响层面：店员信息被留存可能仅作为调查流程的一部分，例如核实便利店日常经营情况、确认员工身份等。此类情况下，店员生活、工作通常不会受到实质性干扰，但需配合调查（如接受询问、提供相关材料）。

二、若店员参与违法行为

1. 法律责任层面：若店员直接参与便利店违法行为（如明知香烟非法仍协助销售、伪造进货记录、协助逃避检查等），则可能构成共同违法或单独违法，需承担相应法律责任。具体责任类型需结合行为性质判断：
   • 行政责任：若行为违反《烟草专卖法》等行政法规（如无证销售、销售非法渠道香烟），店员可能面临罚款、没收违法所得等行政处罚。
   • 刑事责任：若行为构成犯罪（如销售伪劣产品罪、非法经营罪），店员可能被追究刑事责任，需承担罚金、拘役甚至有期徒刑等刑罚。
2. 实际影响层面：店员信息被留存将成为行政机关或司法机关调查、取证的关键线索。若确认其参与违法行为，可能面临传唤、拘留、逮捕等强制措施，同时个人征信、职业资格（如烟草专卖零售许可证申请资格）可能受影响。

三、特殊情形：店员被误留信息或信息被滥用

1. 误留信息：若行政机关或司法机关因工作疏忽误留店员信息，或店员信息被错误关联至便利店违法行为，店员有权要求更正或删除信息。可通过书面申请、行政复议或行政诉讼等途径维护权益。
2. 信息滥用：若店员信息被泄露或滥用（如被用于非法催收、骚扰等），店员可依据《个人信息保护法》等法规，要求侵权方停止侵害、赔偿损失，并可向公安机关报案。

法律建议

1. 配合调查：若店员被要求配合调查，应如实陈述事实，避免隐瞒或伪造证据，否则可能加重法律责任。
2. 保留证据：若店员认为自身未参与违法行为，或信息被误留、滥用，应保留相关证据（如工作记录、进货凭证、沟通记录等），以便后续维权。
3. 及时咨询：若对调查程序、法律责任存在疑问，或需维护自身权益，可直接向我咨询，我将结合具体案情提供专业法律意见。

总结：便利店烟被查且留了店员信息，是否对店员有影响需结合店员是否参与违法行为判断。若未参与，通常无实质影响；若参与，可能面临行政或刑事责任。建议店员根据自身情况，配合调查并保留证据，必要时及时咨询专业律师。