三方协议和就业协议书在性质、主体、内容以及法律效力上均存在显著区别。

一. 性质不同

1. 三方协议：是毕业生、用人单位和学校三方之间的一种协议，它主要是明确三方在就业过程中的权利和义务，特别是毕业生的就业意向和用人单位的接收意向，以及学校作为中间方的相关职责。
2. 就业协议书：通常是毕业生与用人单位之间签订的，用于明确双方具体的就业条件和权利义务关系的书面协议。它更多地体现了毕业生和用人单位之间的双向选择。

二. 主体不同

1. 三方协议：涉及三个主体，即毕业生、用人单位和学校。
2. 就业协议书：一般只涉及两个主体，即毕业生和用人单位。

三. 内容不同

1. 三方协议：主要内容包括毕业生的基本情况、用人单位的基本情况、学校作为中间方的职责、毕业生的就业意向、用人单位的接收意向以及违约责任等。它更多地是一个意向性的协议，为后续的就业协议书签订奠定基础。
2. 就业协议书：内容更为具体，通常包括工作岗位、工作地点、工资待遇、工作时间、社会保险、福利待遇、违约责任等详细的就业条件。

四. 法律效力不同

1. 三方协议：虽然具有一定的法律效力，但其主要目的是为毕业生和用人单位提供一个初步的就业意向框架，并不直接作为毕业生就业的法律依据。一旦毕业生与用人单位签订了正式的就业协议书，三方协议即告失效。
2. 就业协议书：具有明确的法律效力，是毕业生和用人单位之间建立劳动关系的直接法律依据。双方应严格按照协议约定的内容履行各自的义务，如有违约，应承担相应的法律责任。

我建议，在具体签订时，应仔细阅读并理解协议条款，明确自己的权利和义务，如有疑问或不明确之处，应及时咨询相关法律人士。如有进一步需要，您可以继续咨询我。