网上签订的合同中存在格式条款违法行为，一般由合同履行地或者被告住所地的市场监管部门管辖。以下是对此问题的详细分析：
一、管辖原则
在处理网上签订的合同中的格式条款违法行为时，市场监管部门的管辖原则主要遵循《中华人民共和国行政处罚法》以及相关市场监管法规的规定。一般来说，行政处罚由违法行为发生地的县级以上市场监督管理部门管辖，这包括合同履行地和被告住所地。
合同履行地：合同履行地是指合同中约定的履行义务的地点，或者在实际履行中确定的地点。如果格式条款的违法行为在合同履行过程中被发现，那么合同履行地的市场监管部门有权进行管辖。
被告住所地：在涉及格式条款违法行为的合同纠纷中，如果一方当事人（通常是提供格式条款的一方）被认定为违法者，那么其住所地的市场监管部门也有权进行管辖。
二、特殊情况
网络交易平台所在地：对于通过互联网等信息网络签订的合同，如果违法行为发生在网络交易平台上，且该平台有明确的经营地或者注册地，那么该平台所在地的市场监管部门也可能具有管辖权。不过，这一原则通常是在合同履行地和被告住所地难以确定的情况下适用。
上级市场监管部门指定管辖：在特殊情况下，如果两个或者两个以上的市场监管部门对同一违法行为都有管辖权，或者管辖权发生争议，那么可以由它们的共同上级市场监管部门指定管辖。
三、实际操作建议
收集证据：在发现网上签订的合同中存在格式条款违法行为时，首先应当收集相关证据，包括合同文本、交易记录、沟通记录等，以便在后续维权过程中提供有力支持。
确定管辖部门：根据合同履行地、被告住所地或者网络交易平台所在地等信息，确定具有管辖权的市场监管部门。如果不确定，可以咨询当地的市场监管部门或者法律专业人士。
提交投诉或举报：向具有管辖权的市场监管部门提交投诉或举报材料，详细说明违法事实、证据以及诉求等。市场监管部门在收到投诉或举报后，会依法进行调查处理。
寻求法律援助：如果在处理过程中遇到法律难题或者需要进一步的法律支持，可以向我这样的专业律师咨询，以便更好地维护自己的合法权益。
在处理此类问题时，务必保持冷静和理性，通过合法途径维护自己的权益。如果有任何疑问或者需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。