破坏交通设施罪并非由公安机关交通管理部门立案，而是由公安机关的刑事侦查部门负责立案侦查。以下是对此问题的详细分析：

一、立案机关

破坏交通设施罪属于刑事犯罪范畴，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，刑事案件的立案侦查工作由公安机关的刑事侦查部门负责。公安机关交通管理部门主要负责处理交通违法行为和交通事故等行政案件，以及部分轻微的刑事案件的初步处理，但并不负责破坏交通设施罪等严重刑事犯罪的立案侦查工作。

二、破坏交通设施罪的构成要件

1. 主体要件：本罪的主体为一般主体，即年满16周岁且具有刑事责任能力的自然人均可构成。
2. 主观要件：本罪在主观方面表现为故意，包括直接故意和间接故意。行为人明知自己的行为会破坏交通设施的正常运行，并希望或者放任这种结果的发生。
3. 客体要件：本罪侵犯的客体是交通运输安全，这是关系到广大人民群众的生命财产安全和社会稳定的重要领域。
4. 客观要件：本罪在客观方面表现为实施了破坏轨道、桥梁、隧道、公路、机场、航道、灯塔、标志等交通设施的行为，且这些行为足以使火车、汽车、电车、船只、航空器等交通工具发生倾覆、毁坏的危险。

三、立案标准

破坏交通设施罪的立案标准主要依据行为对交通设施造成的破坏程度以及可能引发的后果来判断。具体来说，如果行为人的破坏行为足以使交通工具发生倾覆、毁坏危险，或者已经造成了严重后果（如人员伤亡、重大财产损失等），则应当立案侦查。这些标准体现了法律对破坏交通设施行为的严厉打击态度，旨在维护交通运输安全和社会稳定。

四、法律后果

根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，破坏交通设施罪的法律后果十分严重。如果尚未造成严重后果的，处三年以上十年以下有期徒刑；如果造成严重后果的，如致人重伤、死亡或使公私财产遭受重大损失，则处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑。这些严厉的刑罚措施旨在震慑潜在的犯罪分子，保护交通运输安全。

五、建议与提醒

1. 增强法律意识：公众应增强法律意识，自觉遵守交通运输管理法规，不实施任何破坏交通设施的行为。
2. 及时报警：如果发现有人破坏交通设施或存在其他危及交通运输安全的行为，应立即向公安机关报案。
3. 咨询专业律师：如果您或您身边的人涉及破坏交通设施罪的案件，或者对此类案件有疑问，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。

综上所述，破坏交通设施罪由公安机关的刑事侦查部门负责立案侦查，而非公安机关交通管理部门。公众应增强法律意识，共同维护交通运输安全。