结论概述：根据新闻背景，中通供应链管理公司已完成增资并进行了工商变更，新增股东及注册资本增加。若此次增资及工商变更程序严格遵循了《公司法》及相关法规的规定，包括但不限于股东会决议、修改公司章程、签署增资协议、完成验资程序及向工商行政管理部门提交变更登记申请等，则该程序是合法合规的。以下是对此问题的详细分析：
一、增资及工商变更的合法性基础
股东会决议：根据《公司法》的相关规定，公司增资属于重大事项，需经代表三分之二以上表决权的股东通过，并形成股东会决议。这是增资程序的首要步骤，确保了增资决策的合法性和民主性。
修改公司章程：增资后，公司注册资本发生变化，需相应修改公司章程中关于注册资本的条款，并由全体股东签字或盖章确认。这是确保公司章程与公司实际情况一致性的重要步骤。
签署增资协议：新增股东与原股东之间需签署增资协议，明确增资的具体条款，包括增资金额、出资方式、股权比例等。这是保障各方权益、明确责任义务的关键文件。
完成验资程序：根据《公司法》的规定，公司增资需完成验资程序，由依法设立的验资机构出具验资报告，证明新增资本已足额缴纳。这是确保公司资本真实、合法的重要环节。
工商变更登记：完成上述步骤后，公司需向工商行政管理部门提交变更登记申请，包括股东会决议、修改后的公司章程、验资报告等文件，以完成工商变更登记。这是公司增资及股东变更的法定程序。
二、新闻背景中的法律分析
根据新闻背景，中通供应链管理公司已新增股东并增加了注册资本，且已完成工商变更登记。若上述程序均按照《公司法》及相关法规的规定进行，包括股东会决议的通过、公司章程的修改、增资协议的签署、验资程序的完成及工商变更登记的申请等，则该增资及工商变更程序是合法合规的。
三、可能的法律后果及预防措施
法律后果：若增资及工商变更程序存在瑕疵或违法违规行为，如未召开股东会、未修改公司章程、未签署增资协议、未完成验资程序或未提交变更登记申请等，则可能面临工商行政管理部门责令改正、罚款等行政处罚，甚至可能引发股东之间的纠纷和诉讼。
预防措施：为确保增资及工商变更程序的合法合规性，公司应严格按照《公司法》及相关法规的规定进行操作，包括召开股东会、修改公司章程、签署增资协议、完成验资程序及提交变更登记申请等。同时，公司还应加强内部管理，确保各项决策和程序的透明度和公正性。
四、对公众的启示
对于公众而言，了解公司增资及工商变更的合法程序具有重要意义。这有助于保护股东的合法权益，避免因程序瑕疵或违法违规行为而引发的纠纷和诉讼。同时，也有助于维护市场的公平竞争秩序，促进经济的健康发展。
若您对中通供应链管理公司的增资及工商变更程序有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。