黑社会性质案件主要由公安机关负责侦查，检察机关负责审查起诉，法院负责审判。以下是对这一问题的详细解释：

一、公安机关的职责

在黑社会性质案件中，公安机关是主要的侦查机关。他们负责收集证据、查明犯罪事实、抓捕犯罪嫌疑人，并采取必要的强制措施，如刑事拘留、逮捕等，以确保案件的顺利进行。公安机关在侦查过程中，会依法进行搜查、扣押、勘验、检查等侦查活动，以获取与案件相关的证据和线索。

二、检察机关的职责

检察机关在黑社会性质案件中扮演着重要的角色。他们负责审查公安机关移送的案件材料，对犯罪嫌疑人进行讯问，核实证据，并决定是否对犯罪嫌疑人提起公诉。检察机关在审查起诉过程中，会严格依法办事，确保案件的公正处理。如果检察机关认为案件证据不足或存在其他问题，他们可能会要求公安机关补充侦查或作出不起诉决定。

三、法院的职责

法院是黑社会性质案件的审判机关。他们负责审理检察机关提起公诉的案件，听取控辩双方的意见和证据，并根据事实和法律作出判决。法院在审判过程中，会依法保障被告人的合法权益，确保审判的公正和公平。如果法院认定被告人构成黑社会性质组织罪或其他相关犯罪，他们会依法判处相应的刑罚。

四、其他相关机关的配合

在处理黑社会性质案件时，除了公安机关、检察机关和法院外，还可能涉及其他相关机关的配合。例如，国家安全机关在涉及国家安全的黑社会性质案件中可能会发挥重要作用；司法行政机关则负责监狱等刑罚执行场所的管理和监督工作，确保刑罚的正确执行。

五、法律建议

1. 如果发现黑社会性质组织活动：应及时向公安机关报案，提供相关线索和证据，以便公安机关及时展开侦查工作。
2. 如果涉及黑社会性质案件：应积极配合公安机关、检察机关和法院的工作，如实陈述事实，提供证据，并遵守法律程序。
3. 如果担心自身安全：在报案或配合调查过程中，如果担心自身安全受到威胁，可以向公安机关申请保护措施，如提供临时住所、安排警力保护等。

黑社会性质案件的处理是一个复杂而严肃的过程，需要公安机关、检察机关、法院以及其他相关机关的密切配合和共同努力。如果你有任何关于黑社会性质案件的法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。