十六岁学生犯刑事案件，学校通常不会直接进行刑事处理，但会根据内部规定和实际情况采取相应措施，具体处理方式需结合案件性质、学校规定及学生表现综合判断。以下从不同角度详细说明：

1. 学校无权直接进行刑事处罚
   刑事处罚（如拘役、有期徒刑等）只能由司法机关（法院、检察院、公安机关）根据《刑法》和《刑事诉讼法》作出。学校作为教育机构，无权直接对学生实施刑事处罚，但需配合司法机关调查，提供相关证据或信息。

2. 学校可能采取的内部措施

   • 纪律处分：根据《中小学教育惩戒规则（试行）》或学校内部规章制度，学校可对涉事学生给予警告、记过、留校察看、开除学籍等处分。但需注意，开除学籍需符合法定条件（如严重违反校规且造成重大影响），且需报教育主管部门备案。
     
   • 心理干预与帮扶：学校可能联合心理老师、家长对学生进行心理疏导，帮助其认识错误、改正行为，避免再次犯罪。
     
   • 转学或特殊教育安排：若学生行为严重扰乱教学秩序，学校可能建议其转学或进入专门学校（如工读学校）接受教育，但需经教育部门批准。

3. 司法机关介入后的影响

   • 刑事责任年龄：根据《刑法》第17条，已满16周岁的人犯罪需承担刑事责任。若学生被判刑，学校可能根据判决结果（如缓刑、收监）决定是否保留学籍。
     
   • 缓刑与社区矫正：若学生被判缓刑，需接受社区矫正（如定期报到、参加公益活动等），学校可能配合司法机关监督其表现。
     
   • 犯罪记录影响：刑事犯罪记录可能影响学生未来升学（如报考军校、警校）、就业（如公务员、事业单位招考）及出国签证等。

4. 家长与学校的责任

   • 家长责任：家长需配合学校及司法机关，履行监护职责，督促学生改正行为，并承担可能的民事赔偿责任（如赔偿受害者损失）。
     
   • 学校责任：学校需加强法治教育，预防校园犯罪，并在事件发生后及时报告、配合调查，避免隐瞒或包庇。

建议：若涉及具体案件，建议家长或学生本人直接向我咨询，我会结合案件细节（如犯罪类型、情节轻重、学生表现等）提供更精准的法律分析。