针对有物业的小区出现违章门头的问题，处理流程通常遵循以下步骤，以确保社区秩序和居民合法权益得到妥善维护：

一、发现与劝阻

首先，物业公司作为小区的管理方，有责任在日常巡查中发现任何违章搭建或损坏承重墙结构等违法行为，这包括违章门头的设置。一旦发现此类情况，物业公司应当立即进行劝阻和制止，向相关业主或使用人明确说明违章行为的性质及其可能带来的后果，并要求其立即停止并改正。

二、报告与配合

如果劝阻和制止无效，物业公司应当在规定时间内（如《上海市住宅物业管理规定》中的二十四小时内）向业主委员会和有关行政管理部门报告。这通常包括城管部门或相关执法机构，以便他们能够及时介入，依法对违法行为进行制止或处理。同时，物业公司应积极配合行政管理部门的调查和处理工作，提供必要的证据和信息。

三、执法与拆除

在接到物业公司的报告后，有关行政管理部门会依法进行调查和处理。如果确认存在违章行为，他们会向相关业主或使用人发出整改通知或拆除通知，并要求其在规定时间内自行拆除违章门头。如果业主或使用人拒不执行，行政管理部门有权采取进一步措施，如强制拆除等，以确保社区秩序和居民安全。

四、后续管理与监督

在处理完违章门头后，物业公司应加强对小区的日常巡查和管理，防止类似违章行为的再次发生。同时，他们也应积极配合行政管理部门进行后续监督和管理，确保小区环境的整洁和有序。

此外，值得注意的是，不同地区的具体规定可能有所不同。因此，在处理违章门头时，物业公司应参照当地的相关法规和规定进行操作，并确保所有行为都符合法律法规的要求。

综上所述，处理有物业的小区违章门头需要物业公司、业主委员会和有关行政管理部门的共同努力和协作。通过及时发现、劝阻、报告、配合和执法等步骤，我们可以有效维护社区的秩序和居民合法权益。