房屋使用费在商品房买卖合同纠纷中是适用的，但具体适用情况需根据合同效力及买受人是否善意等因素综合判断。以下是对这一问题的详细分析：
合同无效时的房屋使用费：
- 当商品房买卖合同因出卖人责任被确认无效后，应按无效合同的处理原则进行处理。此时，关于善意买受人是否应支付房屋使用费，以及支付的标准，是一个需要明确的问题。
- 根据最高人民法院的批复，善意买受人在合同无效后，应返还给出卖人房屋使用费。该费用的计算标准通常是以买受人与出卖人约定的合同总价款除以房屋的设计使用年限，再乘以买受人实际使用该房屋的年限得出的价款。这一标准体现了买受人在合同中的意思表示，并考虑了买受人实际使用房屋的情况。
合同有效但买受人违约时的房屋使用费：
- 如果商品房买卖合同本身是有效的，但买受人因自身原因（如资金问题、购房资格问题等）导致合同无法继续履行，此时出卖人是否有权要求买受人支付房屋使用费，则需根据合同具体条款及法律规定来判断。
- 一般来说，如果合同中明确约定了买受人违约时应支付房屋使用费，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么出卖人有权要求买受人支付。但如果合同中没有相关约定，或者约定不明确，出卖人则可能难以直接要求买受人支付房屋使用费。
买受人善意与否的影响：
- 在判断买受人是否应支付房屋使用费时，买受人的善意与否是一个重要因素。善意买受人通常指在签订合同时不知道或不应知道合同存在瑕疵或无效情形的买受人。对于善意买受人，法律在处理时通常会给予一定的保护，如上述提到的房屋使用费计算标准就体现了对善意买受人的保护。
- 如果买受人存在恶意（如明知合同无效仍签订合同），则法律在处理时可能会对其采取更为严格的措施，包括但不限于要求其支付更高的房屋使用费或承担其他法律责任。
地区差异与司法实践：
- 需要注意的是，由于各地区地方法规规定不同，以及司法实践中的差异，房屋使用费在商品房买卖合同纠纷中的具体适用情况可能会有所不同。因此，在处理具体案件时，应结合当地法律法规和司法实践进行综合判断。
综上所述，房屋使用费在商品房买卖合同纠纷中是适用的，但具体适用情况需根据合同效力、买受人是否善意以及地区差异等因素综合判断。如果您在商品房买卖合同纠纷中遇到相关问题，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。