老厂房交土地出让金是否合法，需结合具体情况判断，核心在于土地性质及出让程序是否符合法律规定。以下从不同角度进行分析：
1. 土地性质决定合法性基础
- 若老厂房占用土地为国有建设用地：根据《中华人民共和国城市房地产管理法》第八条，国有土地使用权出让需通过招标、拍卖或挂牌等公开方式，并签订书面出让合同。若老厂房所在土地已依法转为国有建设用地，且出让程序合法（如已补缴出让金、完成土地性质变更），则交土地出让金合法。
- 若老厂房占用土地为集体所有土地：根据《土地管理法》第六十三条，集体经营性建设用地入市需经法定程序（如村民会议表决、政府批准），且仅限用于工业、商业等经营性用途。若老厂房所在土地未依法转为国有，直接交土地出让金可能涉及违法，需先完成集体土地征收或入市程序。
2. 出让程序合规性是关键
- 合法情形：若老厂房土地已通过合法程序（如补办出让手续、缴纳契税及土地出让金）转为出让地，且出让合同明确约定了土地用途、期限及出让金标准，则交土地出让金合法。
- 违法情形：若未履行法定程序（如未签订出让合同、未缴纳契税、未完成土地登记），或出让金标准低于基准地价，可能涉嫌违法。例如，部分地区存在“以租代售”或违规减免出让金的情况，均属违法行为。
3. 历史遗留问题的处理
- 政策性补办手续：对于历史遗留的老厂房（如早期乡镇企业用地），部分地区允许通过补办手续、补缴出让金的方式完善用地手续。此时交土地出让金合法，但需符合地方政策（如补缴比例、期限等）。
- 违规用地的风险：若老厂房长期占用集体土地且未履行任何手续，直接交土地出让金可能无法改变违法状态，仍面临被责令退还土地、罚款等风险。
法律建议
- 核查土地性质：向当地自然资源部门查询老厂房土地的权属（国有/集体）及现状用途。
- 审查出让程序：要求出让方提供出让合同、缴费凭证、政府批文等文件，确认程序是否合法。
- 咨询地方政策：部分地区对老厂房用地有特殊政策（如过渡期安排、补缴标准），需结合地方规定判断。
若您涉及老厂房土地出让金问题，建议提供具体信息（如土地性质、出让程序、地方政策等），以便进一步分析合法性及风险。有问题可直接向我咨询，我将结合法律与实务为您详细解答。