结论：是否赔付需结合等待期确诊疾病与身故原因的关联性、保险合同条款具体约定综合判断，存在两种可能结果。以下分情况详细说明：

1. 若等待期确诊疾病与两年后身故存在直接因果关系，通常不赔付

• 法律依据：根据《保险法》第十六条及定期寿险合同通用条款，等待期内确诊的疾病若导致被保险人死亡，保险公司有权以“等待期出险”为由拒赔。例如，被保险人在等待期内确诊晚期癌症，两年后因癌症转移死亡，保险公司可主张疾病与死亡存在直接因果关系，拒绝赔付。
• 合同条款支撑：多数定期寿险合同会明确约定“等待期内确诊的疾病，无论后续治疗情况如何，若该疾病导致身故，保险公司不承担给付保险金的责任”。

2. 若等待期确诊疾病与两年后身故无直接因果关系，可能赔付

• 法律依据：若被保险人在等待期内确诊的疾病（如轻度甲状腺结节）与两年后身故原因（如交通事故、急性心梗）无关，保险公司需按合同约定赔付。此时，疾病与死亡无因果关系，不符合合同约定的“等待期出险”拒赔情形。
• 合同条款支撑：部分定期寿险合同会区分“疾病身故”与“非疾病身故”，若身故原因属于合同约定的“非疾病身故”范围（如意外伤害），即使等待期内确诊过其他疾病，保险公司仍需赔付。

3. 需重点核查的合同条款

• 等待期定义：确认合同中“等待期”的具体定义（通常为90天或180天），以及“确诊疾病”的范围（是否包括轻症、重疾等）。
• 免责条款：检查合同中“免除保险人责任的条款”，尤其是关于等待期出险、疾病与死亡因果关系的约定。
• 如实告知义务：若被保险人在投保时未如实告知等待期内确诊的疾病，保险公司可能以“未如实告知”为由拒赔，但需符合《保险法》第十六条规定的“故意或重大过失未告知”且“足以影响承保决定”的条件。

4. 实务建议

• 立即核查合同：建议用户或家属尽快查阅保险合同全文，重点标注“等待期”“免责条款”“身故给付条件”等章节。
• 联系保险公司：要求保险公司出具书面拒赔通知（如有），并明确拒赔理由及合同依据。
• 法律救济途径：若对拒赔决定有异议，可向当地保险行业协会申请调解，或直接向法院提起诉讼，主张保险公司履行赔付义务。

提示：定期寿险的赔付结果高度依赖合同条款的具体约定，不同保险公司的条款可能存在差异。若您手中有保险合同或拒赔通知，可直接向我提供具体条款内容，我将进一步为您分析。