企业被强制注销已过三年，一般情况下不能依据新实施办法直接撤销，但存在特定情形时可能有机会撤销。以下从不同角度进行分析：
一、一般情况下的不可撤销性
企业被强制注销，通常意味着该企业已经完成了法定的注销程序，其主体资格已经消灭。在注销后的一段时间内（如三年），如果没有特定的法律依据或法定程序，一般不能随意撤销该注销行为。这是因为注销行为一旦完成，就产生了相应的法律后果，包括企业财产的清算、债务的清偿、税务的注销等，这些后果的完成标志着企业法律关系的终结。
二、特定情形下的可撤销性
尽管一般情况下注销行为不可撤销，但在某些特定情形下，如存在以下情况，可能有机会撤销注销：
注销程序存在瑕疵：如果企业在注销过程中存在违反法定程序或规定的情况，如未依法进行清算、未通知债权人等，相关利害关系人（如债权人、股东等）可能有权向法院提起诉讼，请求撤销注销行为。然而，这种情况下的撤销请求通常需要在注销后的一定期限内提出，且需要提供充分的证据证明注销程序存在瑕疵。但已过三年，从时间上看，可能已超过法定的诉讼时效或撤销权行使期限，不过具体还需结合相关法律法规及案件具体情况判断。
新实施办法有特别规定：如果新实施的办法中明确规定了在特定条件下可以撤销已注销企业的情形，且该企业的情况符合这些条件，那么理论上可以依据新办法申请撤销。但这种情况较为罕见，且需要新办法具有明确的、可操作的撤销条款。目前并未有普遍适用的新实施办法明确规定可以撤销已注销三年以上的企业，因此这一角度的可能性相对较小。
行政机关的自我纠正：在极少数情况下，如果行政机关在注销过程中存在错误或违法行为，且该错误或违法行为被及时发现并纠正，行政机关可能主动撤销注销决定。但这种情况同样需要满足一定的条件，且行政机关的自我纠正行为通常受到严格的法律监督和制约。对于已过三年的注销行为，行政机关主动撤销的可能性也相对较低。
三、法律建议
审查注销程序：如果认为企业注销过程中存在瑕疵或违法行为，建议首先审查注销程序是否符合相关法律法规的规定，并收集相关证据。
咨询专业律师：由于撤销注销行为涉及复杂的法律程序和证据要求，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。我可以为你提供婚姻家庭、公司事务、刑事辩护领域的专业法律咨询，如果你有相关问题，可以直接向我提问。
关注新法律法规：虽然目前并未有普遍适用的新实施办法明确规定可以撤销已注销三年以上的企业，但仍需关注相关法律法规的更新和变化，以便及时了解最新的法律动态和可能的救济途径。
综上所述，企业被强制注销已过三年后，一般情况下不能直接依据新实施办法撤销。但在特定情形下，如注销程序存在瑕疵、新实施办法有特别规定或行政机关自我纠正等，可能有机会撤销。因此，在具体情况下需结合相关法律法规和案件具体情况进行判断。