行政补偿案件确实存在诉讼时效，具体规定如下：
一、一般规定
直接提起行政诉讼的时效：
- 根据《中华人民共和国行政诉讼法》第四十六条，公民、法人或其他组织直接向人民法院提起诉讼的，应当自知道或应当知道作出行政行为之日起六个月内提出。这一规定同样适用于涉及行政补偿金的案件。例如，如果行政机关作出了关于补偿金的行政行为（如支付或不支付补偿金的决定、确定补偿金数额的决定等），当事人若选择直接向法院起诉该行政行为，就必须遵守上述诉讼时效的规定。
- 特别地，对于因不动产提起的诉讼案件，自行政行为作出之日起超过二十年将不予受理；而对于其他类型的案件，这一期限是五年。
经过复议后再起诉的时效：
- 依据《中华人民共和国行政诉讼法》第四十五条，如果公民、法人或其他组织对行政复议决定不服，可以在收到复议决定书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。若复议机关逾期未作决定，申请人则可在复议期满之日起十五日内向法院提起诉讼。这一规定也适用于涉及补偿金的行政案件。例如，当事人对行政机关关于补偿金的决定不满，先申请行政复议，然后对复议结果仍不满意，就需严格遵守收到复议决定书后十五日的起诉期限。
二、特殊情形下的时效调整
行政机关未履行告知义务时的时效：
- 当行政机关在作出涉及补偿金的行政行为时，如果未告知公民、法人或其他组织起诉期限，根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国行政诉讼法〉的解释》第六十四条，起诉期限将从公民、法人或其他组织知道或应当知道起诉期限之日起计算，但最长不得超过从知道或应当知道行政行为内容之日起的一年。这一规定确保了当事人在不知情的情况下也能获得合理的起诉时间。
不知道行政行为内容时的时效：
- 根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国行政诉讼法〉的解释》第六十五条，如果公民、法人或其他组织不知道行政机关作出的行政行为内容，其起诉期限将从知道或应当知道该行政行为内容之日起计算，并受《行政诉讼法》第四十六条第二款规定的最长起诉期限的限制。即，因不动产的案件最长不超过二十年，其他案件最长不超过五年。
特殊情况下的时效延长：
- 如果存在某些特殊情况，如因不可抗力等因素导致无法在规定时间内提起诉讼，法院可以根据实际情况适当延长诉讼时效期限。这为当事人在面临不可抗拒的困难时提供了法律上的救济途径。
三、法律建议
- 及时咨询：如果认为自己有权获得补偿金且行政机关未主动支付，务必及时咨询专业律师，以了解具体的诉讼时效规定和起诉策略。
- 准备证据：在提起诉讼前，应充分准备相关证据，如行政机关作出的行政行为决定书、复议决定书等，以证明自己的权益受到损害以及起诉期限的起算点。
- 遵守时效：务必在规定的时效期限内提起诉讼，以避免可能面临的法律不利后果。如果因特殊情况无法及时提起诉讼，应及时向法院申请延长诉讼时效期限。
综上所述，行政补偿案件确实存在诉讼时效，且具体规定因提起方式及特殊情况而有所不同。因此，在处理行政补偿案件时，务必密切关注诉讼时效的起算点、中断及延长情况，以确保自己的合法权益得到及时有效的法律保护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。