结论前置：在民事诉讼中，若被告与妻子离婚且房产登记在其妻子名下，执行房产需根据房产性质、购买时间及资金来源等因素综合判断，具体可分为以下几种情况处理。

1. 若房产为被告个人财产（婚前购买且无婚后还贷）
   根据《民法典》第1063条，婚前个人财产不因婚姻关系转化为共同财产。若房产系被告婚前全款购买且登记在其个人名下（或婚后未用共同财产还贷），则该房产属于被告个人财产，法院可直接执行。但需注意：

   • 若被告与妻子离婚时通过离婚协议或判决将房产赠与妻子，需先撤销赠与或确认赠与无效（如存在恶意转移财产情形），再恢复执行标的。
     
   • 执行时需提供房产产权证明、购买合同等证据，证明房产归被告所有。

2. 若房产为夫妻共同财产（婚后购买或婚前购买但婚后共同还贷）
   根据《民法典》第1062条，婚后购买的房产或婚前购买但婚后用共同财产还贷的房产，原则上属于夫妻共同财产。此时执行需分两步：

   • 第一步：析产诉讼
     需通过诉讼确认被告在房产中的份额（通常为50%，但若存在出资比例差异可调整）。例如，若房产系婚后购买且双方无特殊约定，法院会判决被告享有50%产权。
     
   • 第二步：执行份额
     法院可对被告的50%产权进行拍卖、变卖，但需注意：
     
     • 若房产为唯一住房，执行可能受限（需保障被执行人及其扶养家属的基本居住权）；
       
     • 若妻子提出异议，认为房产归其所有，需通过执行异议之诉解决。

3. 若房产登记在妻子名下但实际为被告财产（如代持、隐名投资）
   若存在证据证明房产虽登记在妻子名下，但实际出资人为被告（如转账记录、代持协议等），可主张“实际权利与登记不一致”，通过以下途径解决：

   • 提起案外人执行异议之诉：若房产已被其他债权人申请执行，被告可主张自己是实际权利人，要求停止执行；
     
   • 确认财产归属诉讼：直接起诉妻子，要求确认房产归被告所有，再申请执行。

4. 若离婚时财产分割存在瑕疵（如未分割、显失公平）
   若被告认为离婚时财产分割不公（如妻子隐匿财产、低价转移），可依据《民法典》第1092条，在离婚后1年内申请撤销财产分割协议，重新分割财产后执行。但需注意：

   • 撤销权行使期限为1年，自知道或应当知道权利受损之日起计算；
     
   • 需提供证据证明分割存在欺诈、胁迫等情形。

实务建议：

• 执行前需全面调查房产产权、购买时间、资金来源等证据，必要时申请法院调查令；
  
• 若涉及夫妻共同财产，建议同步提起析产诉讼，避免执行程序拖延；
  
• 若存在代持、隐名投资等情形，需提前固定证据（如转账记录、聊天记录等），防止证据灭失。
  

如有具体案件细节（如房产购买时间、出资情况、离婚协议内容等），可进一步向我咨询，我会结合证据为您制定执行方案。