公司实际控制人为其母公司董事的公司，通常会被认定为关联方。以下从不同角度进行详细分析：
一、关联方的法律定义与认定标准
根据《企业会计准则第36号——关联方披露》及相关法律法规，关联方通常指的是一方控制、共同控制另一方或对另一方施加重大影响，以及两方或两方以上同受一方控制、共同控制或重大影响的情况。在实际操作中，关联方的认定往往基于控制关系、共同控制关系或重大影响关系。
控制关系：如果一家公司能够决定另一家公司的财务和经营政策，并能据以从该公司的经营活动中获取利益，那么这两家公司之间就存在控制关系。在这种情况下，控制方和被控制方通常会被认定为关联方。
共同控制关系：如果两家或两家以上的公司共同控制另一家公司，那么这些公司之间以及它们与被控制的公司之间通常也会被认定为关联方。
重大影响关系：如果一家公司对另一家公司的财务和经营政策有参与决策的权力，但并不能够控制或者与其他方一起共同控制这些政策的制定，那么这两家公司之间可能存在重大影响关系。在这种情况下，它们也可能被认定为关联方。
二、公司实际控制人为其母公司董事的情况分析
控制关系角度：如果公司实际控制人同时担任其母公司的董事，这通常意味着母公司对公司具有控制权或重大影响。在这种情况下，公司与其母公司之间存在控制关系或重大影响关系，因此它们之间会被认定为关联方。
关联交易与利益输送风险：从关联交易和利益输送的角度来看，如果公司实际控制人同时担任母公司董事，可能会增加关联交易和利益输送的风险。因为实际控制人可能利用其在母公司的地位和影响力，为公司谋取不正当利益或损害母公司及其他股东的利益。这种风险的存在也进一步支持了将公司与其母公司认定为关联方的观点。
三、实际案例与监管实践
在实际操作中，监管机构和会计准则制定机构通常会根据公司的股权结构、治理结构以及实际控制情况等因素来综合判断两家公司之间是否存在关联关系。如果公司实际控制人同时担任其母公司的董事，并且这种关系对公司或母公司的财务和经营政策产生了重大影响，那么这两家公司之间很可能会被认定为关联方。
四、法律建议与风险提示
完善公司治理结构：为了避免关联交易和利益输送的风险，公司应完善其治理结构，确保决策过程的透明度和公正性。
加强信息披露：公司应按照相关法律法规的要求，及时、准确、完整地披露其关联方关系和关联交易情况，以便投资者和监管机构进行监督和评估。
寻求专业法律意见：如果公司对关联方的认定存在疑问或需要进一步的法律指导，建议寻求专业律师的法律意见，以确保公司的合规运营和风险控制。
如有任何疑问或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询。