若发现法院调查令调出来的证据被篡改，你可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
立即向法院报告：
- 一旦发现证据被篡改，应第一时间向出具调查令的法院报告此事。法院作为中立的司法机关，有责任和义务对证据的真实性和完整性进行审查。
- 报告时，应详细说明证据被篡改的情况，包括篡改的时间、地点、方式以及可能的影响等，以便法院能够迅速采取行动。
申请证据保全或重新调查：
- 你可以向法院申请对原始证据进行保全，以防止其进一步被篡改或销毁。证据保全可以确保原始证据在后续诉讼中的可用性和证明力。
- 如果认为篡改行为严重影响了证据的真实性和证明力，你还可以申请法院重新进行调查，以获取真实、完整的证据。
追究篡改者的法律责任：
- 篡改法院调查令调出的证据属于妨碍司法公正的行为，可能构成犯罪。你可以向公安机关报案，要求追究篡改者的刑事责任。
- 同时，你也可以在民事诉讼中要求篡改者承担民事责任，如赔偿因篡改证据给你造成的损失等。
在诉讼中提出异议：
- 如果在诉讼过程中发现对方提交的证据是被篡改的，你可以在法庭上提出异议，要求法院对证据的真实性和合法性进行审查。
- 你可以提供相关证据或线索，证明对方提交的证据存在篡改行为，从而削弱其证明力或使其被排除在定案依据之外。
法律背景与建议：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》等相关法律法规的规定，证据应当真实、合法、关联，且不得伪造、篡改。篡改证据的行为严重违反了法律规定，破坏了司法公正和诉讼秩序。
- 在处理此类问题时，建议你保持冷静和理性，及时收集并保存相关证据和线索。同时，你也可以寻求专业律师的帮助，以便更好地维护自己的合法权益。
可能的法律后果：
- 如果篡改证据的行为被查实，篡改者可能面临刑事处罚，如伪造证据罪等。
- 在民事诉讼中，篡改证据的行为可能导致对方提交的证据被排除在定案依据之外，从而影响其诉讼结果。同时，篡改者还可能因妨碍民事诉讼而被法院处以罚款、拘留等处罚。
如果你在处理此类问题时遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业、全面的法律建议和帮助。