结论：司机下车整理货物被货物砸死，能否要求车辆的商业第三者责任保险赔偿，需视具体情况而定，但通常情况下，若司机被认定为“第三者”，则可能获得赔偿；若被认定为“车上人员”，则可能无法获得赔偿。保险公司拒赔的理由可能包括司机不属于“第三者”范畴、事故不属于保险责任范围或存在免责事由等。
分析：
“第三者”与“车上人员”的界定：
- 在商业第三者责任保险中，“第三者”通常指的是除被保险车辆上的乘客和驾驶员以外的第三方。若司机下车后，其身份已从“车上人员”转变为“车外人员”，且在整理货物过程中被货物砸死，那么从理论上讲，他有可能被视为“第三者”。
- 然而，具体是否属于“第三者”还需根据保险合同的约定以及相关法律法规进行判断。有些保险合同可能明确规定，即使驾驶员下车，其身份仍视为“车上人员”，从而不享受第三者责任险的赔偿。
保险公司的拒赔理由：
- 不属于“第三者”范畴：如前所述，若保险公司认为司机下车后仍属于“车上人员”，则可能拒绝赔偿。
- 事故不属于保险责任范围：商业第三者责任保险通常覆盖因被保险车辆的使用导致的第三者人身伤亡或财产损失。若保险公司认为事故不属于保险责任范围（如因货物堆放不当导致的意外），则可能拒赔。
- 存在免责事由：保险合同中可能包含一些免责条款，如被保险人故意造成的事故、驾驶员无证驾驶或酒后驾驶等。若事故涉及这些免责事由，保险公司可能拒绝赔偿。
法律建议：
- 审查保险合同：首先，应仔细审查保险合同中的相关条款，特别是关于“第三者”和“车上人员”的界定以及免责条款的内容。
- 收集证据：若认为保险公司拒赔不合理，应收集相关证据（如事故现场照片、证人证言、医疗记录等）以支持自己的主张。
- 寻求法律援助：若与保险公司协商无果，可考虑寻求法律援助或提起诉讼。在此过程中，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议。
可能的法律后果：
- 若法院最终认定司机属于“第三者”且事故属于保险责任范围，则保险公司应承担赔偿责任。
- 若法院认定司机不属于“第三者”或事故不属于保险责任范围，或存在免责事由，则保险公司可能无需承担赔偿责任。
后续行动建议：
- 若您或您的家人遇到此类情况，建议首先与保险公司沟通并了解其拒赔的具体理由。
- 若认为保险公司的拒赔理由不充分或不合理，可考虑咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。
- 在处理此类纠纷时，务必保持冷静和理性，依法维护自己的合法权益。
如有任何进一步的问题或需要更具体的法律建议，请随时向我咨询。