同城市的两个分公司即使不是一个法人，它们之间仍然存在一定的法律关系，主要体现在它们同属于一个总公司或母公司的控制和管理之下。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

1. 分公司与总公司的法律关系

分公司是总公司的一个分支机构，它并不具备独立的法人资格。这意味着，分公司不能独立承担民事责任，其民事责任由总公司承担。因此，无论两个分公司是否位于同一城市，或者是否由同一个法人代表管理，它们在法律上都是总公司的一部分，受总公司的统一管理和控制。

2. 分公司之间的法律关系

• 管理与被管理关系：由于分公司是总公司的分支机构，它们之间通常存在管理与被管理的关系。这种关系主要体现在业务运营、财务管理、人员调配等方面。即使两个分公司不是由同一个法人代表管理，它们仍然需要遵循总公司的规章制度和管理要求。
• 业务协作关系：在实际运营中，分公司之间可能会因为业务需要而进行协作。这种协作可能涉及资源共享、信息交流、技术合作等方面。虽然这种协作不是法律上的强制要求，但出于业务效率和成本考虑，分公司之间往往会建立这种协作关系。
• 法律责任连带性：虽然分公司不具备独立的法人资格，但在某些情况下，一个分公司的行为可能会影响到其他分公司或总公司的法律责任。例如，如果一个分公司因违法行为而承担法律责任，这种责任可能会追溯到总公司或其他分公司，具体取决于违法行为的性质和后果。

3. 法人代表的影响

• 法人代表的独立性：每个分公司可能有自己的法人代表（在分公司不具有法人资格的情况下，这里的“法人代表”实际上是指分公司的负责人），但这并不改变分公司作为总公司分支机构的法律地位。法人代表的变更或不同，不会影响分公司之间的法律关系。
• 法人代表的责任：虽然法人代表在分公司中扮演重要角色，但他们并不对分公司的所有行为承担个人责任。分公司的民事责任仍然由总公司承担。当然，如果法人代表在执行职务过程中存在违法行为，他们可能需要承担个人法律责任。

4. 实际运营中的考虑

• 内部管理协调：在实际运营中，总公司需要协调各个分公司之间的业务和管理活动，以确保整体运营的高效和顺畅。这包括制定统一的规章制度、管理流程、业务标准等。
• 风险防控：总公司需要关注各个分公司的运营风险，并采取相应的防控措施。这包括对分公司的财务状况、业务合规性、人员管理等方面进行监督和检查。

建议：

• 对于总公司而言，应加强对各个分公司的管理和监督，确保它们遵守法律法规和总公司的规章制度。
• 对于分公司而言，应积极与总公司和其他分公司进行沟通和协作，共同推动业务的发展。
• 如果在分公司运营过程中遇到法律问题或纠纷，应及时向总公司报告并寻求法律支持。

如果有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。