对违反传染病防治法规定的医疗机构，最高可处的罚款并非一个固定数额，而是根据违法行为的性质和后果来确定的，不过在特定情形下，如非法采集血液或者组织他人出卖血液，可并处十万元以下的罚款，这是针对此类严重违法行为的一个明确罚款上限。具体来说：
一般违法情形：
- 医疗机构若未按照规定承担传染病预防、控制工作等，通常首先会面临责令改正、通报批评、给予警告等行政处罚。
- 若造成传染病传播、流行或其他严重后果，对负有责任的主管人员和其他直接责任人员，会依法给予降级、撤职、开除的处分，并可以依法吊销有关责任人员的执业证书。但在此类一般违法情形中，并未直接规定对医疗机构的罚款上限。
特定严重违法情形：
- 根据《中华人民共和国传染病防治法》第七十条，若采供血机构未按照规定报告传染病疫情，或者隐瞒、谎报、缓报传染病疫情，或者未执行国家有关规定，导致因输入血液引起经血液传播疾病发生的，除了对责任人员给予处分外，若构成犯罪，还会依法追究刑事责任。
- 特别地，对于非法采集血液或者组织他人出卖血液的行为，由县级以上人民政府卫生行政部门予以取缔，没收违法所得，可以并处十万元以下的罚款。这是针对此类严重违法行为的一个明确罚款上限。
其他相关考虑：
- 除了行政处罚外，若医疗机构的行为构成犯罪，如引起甲类传染病传播或有传播严重危险，还会依据《中华人民共和国刑法》的相关规定追究刑事责任。
- 罚款只是行政处罚的一种形式，对于医疗机构来说，更严重的后果可能包括吊销执业证书、对责任人员给予严厉处分等。
法律建议：
- 医疗机构应严格遵守《中华人民共和国传染病防治法》及相关规定，确保传染病预防、控制工作的有效进行。
- 一旦发现违法行为，应立即采取措施进行纠正，并主动接受卫生行政部门的监督和处罚。
- 对于可能涉及犯罪的行为，医疗机构应积极配合司法机关的调查和处理工作。
可能法律后果：
- 若医疗机构违反传染病防治法规定且未及时纠正，可能面临严重的行政处罚和刑事责任。
- 罚款只是其中一部分后果，更严重的可能包括医疗机构声誉的损害、业务量的下降以及长期法律风险的增加。
因此，医疗机构应高度重视传染病防治工作，确保合规经营，以避免可能的法律后果。如果有任何具体的法律问题或疑虑，可以直接向我咨询。