针对您提出的问题，即母亲不配合拒绝补办出生证明，父亲仅凭亲子鉴定能否为孩子上户口，以下是我的详细解答：
首先，我们需要明确的是，新生儿上户口通常需要提供出生医学证明、父母双方的身份证、结婚证（或非婚生育说明）等相关材料。这是户籍管理的基本规定，旨在确保户籍登记的准确性和合法性。
然而，在您所描述的情况下，母亲不配合补办出生证明，这确实给上户口带来了一定的困难。但根据相关规定和实际操作经验，如果无法取得出生医学证明，并非完全无法上户口。具体来说，有以下几种途径可以考虑：
申请补发出生医学证明：
- 尽管母亲不配合，但父亲仍可以尝试向卫健部门申请补发出生医学证明。这通常需要提供一些额外的材料，如父母的身份证明、孩子的出生记录等，以证明孩子的出生事实。
- 如果卫健部门能够核实相关信息并补发出生医学证明，那么父亲就可以按照正常流程为孩子上户口。
提供亲子鉴定证明：
- 如果无法补发出生医学证明，或者补发过程中遇到困难，父亲可以提供具有资质的鉴定机构出具的亲子鉴定证明。
- 亲子鉴定证明是确认孩子与父亲之间亲子关系的重要依据，对于非婚生育子女随父亲申报出生登记的情况，这一证明通常是必需的。
- 需要注意的是，不同地区的户籍管理部门可能对亲子鉴定证明的具体要求有所不同，因此父亲在提供证明前最好先咨询当地户籍管理部门。
遵循当地户籍管理部门的特殊规定：
- 除了上述两种途径外，不同地区的户籍管理部门可能还有一些特殊的规定或流程。例如，有些地区可能要求提供额外的证明材料或进行额外的调查核实。
- 因此，父亲在为孩子上户口前，最好先了解当地户籍管理部门的具体要求和流程，以便更好地准备相关材料并顺利办理户口登记。
综合建议：
- 父亲应首先尝试与母亲沟通，争取其配合补办出生医学证明。这是最直接、最简便的途径。
- 如果沟通无果，父亲可以咨询当地卫健部门，了解补发出生医学证明的具体流程和所需材料，并尝试申请补发。
- 如果补发出生医学证明存在困难或无法补发，父亲可以提供亲子鉴定证明，并遵循当地户籍管理部门的特殊规定和流程为孩子上户口。
最后，需要强调的是，户籍登记是公民的重要权益之一，父亲应积极为孩子办理户口登记，以确保孩子的合法权益得到保障。同时，也希望母亲能够理解并配合这一过程，共同为孩子的未来负责。