工程结算通知单双方盖章签字通常是有效的，但具体效力需结合实际情况判断。以下从多个角度进行分析：

1. 法律层面分析

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这一规定明确了签字、盖章或按指印均可作为合同成立的有效方式，并未强制要求必须同时具备。因此，从法律层面讲，工程结算通知单双方盖章签字是有效的，盖章行为本身即代表了公司的意思表示，是公司法人意志的体现。

2. 交易习惯与合同约定

   • 交易习惯：如果双方在长期的合作过程中，已经形成了通过盖章签字确认工程结算通知单的交易习惯，那么这种习惯会被视为双方之间的默示约定，结算通知单的效力会得到认可。
   • 合同约定：然而，如果双方签订的建设工程合同中明确约定了工程结算通知单必须加盖公司公章或合同专用章，并且必须由特定人员签字才有效，那么仅盖章签字可能不符合合同约定，导致结算通知单效力存在瑕疵。在这种情况下，双方应严格按照合同约定执行，以避免潜在的法律风险。

3. 实际操作中的注意事项

   • 确保盖章真实无误：在盖章时，应确保所盖印章真实、有效，且未被滥用或盗用。如果因印章问题导致结算通知单无效，将给双方带来不必要的损失。
   • 签字人员权限：签字人员应具备相应的权限和资格，能够代表公司或项目部进行结算确认。如果签字人员无权或超越权限签字，可能导致结算通知单无效。
   • 保留相关证据：为了证明结算通知单的效力，双方应保留好相关证据，如合同、往来函件、会议纪要等。这些证据可以在发生纠纷时提供有力的支持。

4. 纠纷解决方式

   • 如果在工程结算中因盖章签字问题产生纠纷，双方可以首先尝试通过友好协商解决争议。如果协商无果，可以寻求第三方调解机构介入，帮助双方达成和解。如果调解仍然无法解决问题，当事人可以根据合同约定或法律规定选择仲裁或诉讼方式解决纠纷。

举例说明：

• 假设甲乙双方签订了一份建设工程合同，合同中明确约定了工程结算通知单必须加盖公司公章并由项目经理签字才有效。在工程结算时，乙方仅加盖了项目部章并由普通工作人员签字，那么这份结算通知单可能因不符合合同约定而被认定为无效。
• 相反，如果双方合同中没有明确约定结算通知单的盖章签字要求，且双方长期以来一直通过盖章签字的方式确认工程结算通知单，那么这种结算方式通常会被认定为有效。

建议：

• 为了确保工程结算通知单的合法有效，建议双方在合同签订时明确约定结算通知单的盖章签字要求，并在实际履行过程中严格遵守相关规定。
• 如有任何疑问或不确定之处，应及时咨询专业律师以避免潜在的法律风险。

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