行政案件档案（这里主要指行政诉讼档案）的归档后保存期限，是根据档案的重要程度、性质以及查考利用价值来明确划分的，主要分为永久、长期和短期三类。以下是对这三类保存期限的详细解释：

一、永久保管

对于具有重大保存价值的行政诉讼档案，应实施永久保管。这类档案往往涉及重大的历史事件、关乎重大公共利益，或是具有里程碑意义的典型案例。它们不仅为后续的法律研究提供了详实的资料，也是法律发展史上的宝贵财富。因此，永久保管这些档案，对于维护法律体系的连续性和稳定性具有重要意义。

二、长期保管

长期保管的行政诉讼档案，其保存期限一般为60年（部分情况下可能为30年，具体根据档案的重要性和实际需求确定）。这类档案通常涉及比较复杂的法律关系，或具有一定社会影响。通过长期保存，可以确保在需要时能够回溯案件细节，为相关决策提供有力支持。同时，长期保管也体现了对法律历史文化的尊重与传承。

三、短期保管

短期保管的行政诉讼档案，其保存期限为10年。这类档案主要是一般性、事务性的案件记录，它们在较短时间内可能对机关工作有参考价值，但长期来看其价值会逐渐降低。因此，采用短期保管方式，既满足了当前的工作需求，又避免了资源的浪费。

实际操作与法律规定

在实际操作中，各相关单位应严格按照《中华人民共和国档案法》及其实施办法的规定，对行政诉讼档案进行分类、保存和移交工作。这包括定期向档案馆移交档案，确保档案的完整性和安全性。同时，对于电子档案和档案数字复制件，也需要按照相关要求进行存储和管理。

需要注意的是，不同地区、不同法院可能会根据实际情况对保管期限的具体执行存在细微差异。但总体来说，都应遵循法律法规的要求，确保每一份档案都能得到妥善的处理和保管。

综上所述，行政案件档案的归档后保存期限是一个严谨而细致的问题，它直接关系到法律历史的传承、法律文化的积淀以及法律实践的高效运行。因此，我们必须高度重视这一问题，严格按照法律法规的要求进行操作。