在开具犯罪证明时，若存在违法行为，是否会备注取决于违法行为的性质、处理结果以及相关法律法规的具体规定。以下是对此问题的详细分析：

1. 违法行为的性质与处理结果

• 轻微违法行为：对于一些轻微的违法行为，如交通违章、轻微的扰乱公共秩序等，如果仅受到行政处罚（如罚款、警告等），且未构成犯罪，那么在开具犯罪证明时，通常不会对此类违法行为进行备注。因为犯罪证明主要关注的是犯罪记录，而非一般的行政违法行为。
• 严重违法行为或犯罪记录：如果违法行为严重到构成犯罪，并且已经经过司法程序处理，如被判处刑罚（包括有期徒刑、拘役、管制等），那么在开具犯罪证明时，这一犯罪记录是会被明确备注的。这是犯罪证明的核心内容，用于证明个人是否存在犯罪历史。

2. 相关法律法规的具体规定

• 犯罪证明的内容：根据相关法律法规，犯罪证明通常包括个人的基本信息、犯罪记录（如有）以及处理结果等。对于未构成犯罪的违法行为，一般不在犯罪证明中体现。
• 特殊情况：在某些特殊情况下，如涉及国家安全、社会稳定等重大利益时，相关部门可能会根据法律法规的要求，对个人的违法行为进行更全面的调查和记录。但这种情况较为罕见，且通常有严格的法律程序和规定。

3. 实际操作中的差异

• 地区差异：不同地区在开具犯罪证明时，可能存在具体的操作差异。有些地区可能更加严格，对个人的违法行为记录进行更详细的审查；而有些地区则可能更加宽松，仅关注犯罪记录。
• 机构差异：不同机构在开具犯罪证明时，也可能存在差异。例如，公安机关开具的犯罪证明可能更加全面和详细；而其他机构（如法院、检察院等）则可能根据具体需求开具证明。

4. 建议与注意事项

• 了解具体规定：在需要开具犯罪证明时，建议先了解当地的具体规定和操作流程。这可以通过咨询当地公安机关或相关机构来获取。
• 保持诚信：无论是否存在违法行为或犯罪记录，都应保持诚信态度。在申请犯罪证明时，应如实提供个人信息和情况说明。
• 寻求法律帮助：如果对开具犯罪证明的过程或结果有疑问或争议，可以寻求专业律师的法律帮助。律师可以提供具体的法律建议和指导，帮助解决问题。

如果有任何关于犯罪证明或其他法律问题的疑问，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况和需求，提供专业的法律建议和帮助。