船舶在沪通大桥水域超速行驶的处罚，需结合具体超速情节、水域管理规定及海事部门执法标准综合判定，一般包括行政处罚与安全教育两类措施。具体分析如下：

1. 行政处罚：罚款为主，情节严重可能扣证

根据《中华人民共和国海上交通安全法》《内河交通安全管理条例》及地方性航行规则（如长江江苏段船舶定线制规定），船舶超速行驶可能面临以下处罚：

• 一般超速（未造成事故）：海事部门可对船长或责任船员处以500元至1万元罚款，具体金额根据超速比例（如超过限速10%-30%、30%以上等）和船舶吨位确定。例如，小型船舶超速20%可能罚500-2000元，大型船舶超速30%以上可能罚5000-1万元。
• 严重超速或引发事故：若超速导致碰撞、搁浅等事故，或拒不执行海事部门限速指令，可能面临扣留船员适任证书3-6个月，甚至吊销证书；船舶所有人或经营人也可能被处以更高罚款（如2万-10万元）。

2. 安全教育：强制学习或考试

除罚款外，海事部门可能要求责任船员参加水上交通安全培训，或通过船员考试系统完成超速违规相关科目学习，考核合格后方可继续任职。此措施旨在强化安全意识，减少重复违规。

3. 特殊情形：沪通大桥水域的专项规定

沪通大桥位于长江下游，属于内河高等级航道，其通航孔、桥区水域可能设有局部限速区（如通过桥孔时限速8节以下）。若船舶在该区域超速，处罚可能更严格：

• 桥区超速：因桥区水流复杂、通航高度受限，超速易引发船舶失控或触碰桥梁，海事部门可能按“情节严重”从重处罚，罚款上限可能提高至2万元。
• 夜间或能见度不良时超速：若在夜间、雾天等低能见度条件下超速，处罚力度可能进一步加大，同时可能要求船舶停航整改。

建议：船舶航行前应通过海事部门公告、航行通告等渠道确认沪通大桥水域限速要求，航行中保持安全航速，避免因超速承担法律责任。若已收到超速处罚通知，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，但需在收到处罚决定书之日起60日内提出。如有具体案件细节，可直接向我咨询进一步分析。