网络办卡电子协议是有效的。这一结论主要基于以下几点法律和政策依据：

首先，根据《中华人民共和国电子签名法》第三条的规定，民事活动中的合同或其他文件、单证等文书，当事人可以约定使用电子签名、数据电文。这意味着，只要双方当事人同意并约定使用电子形式来签署协议，那么该电子协议就具有法律效力，不得仅因其采用电子形式而被否定。

其次，从政务服务领域的实践来看，国家积极推动电子证照、电子材料的共享和应用。例如，《国务院关于在线政务服务的若干规定》第十条明确指出，电子证照与纸质证照具有同等法律效力。这一规定不仅适用于政务服务，也体现了电子文件在法律上的认可度和效力。

再者，具体到网络办卡这一场景，虽然直接的法律条文可能并未明确提及“网络办卡电子协议”，但我们可以从电子合同、电子签名的普遍法律效力出发进行推断。网络办卡过程中，用户与办卡机构之间通过电子方式签署的协议，本质上是一种电子合同。只要该合同符合电子合同的相关要求，如双方真实意愿的表达、合同内容的明确性、电子签名的合法性等，那么该电子协议就是有效的。

此外，各地政府和相关机构也在积极推动电子证照、电子合同的应用。例如，上海等地已经建立了电子证照库和电子印章系统，为电子证照、电子合同的广泛应用提供了技术支撑和制度保障。这些实践进一步证明了电子协议在法律上的有效性和可行性。

综上所述，网络办卡电子协议是有效的。用户在签署此类协议时，应仔细阅读协议内容，确保自己了解并同意协议中的各项条款。同时，办卡机构也应确保电子协议的合法性和有效性，以维护双方的合法权益。