医疗机构使用消毒产品治疗疾病，属于违法行为，将面临行政处罚，情节严重的还可能承担刑事责任。具体分析如下：
行政处罚：
- 根据《中华人民共和国传染病防治法》及《消毒管理办法》的相关规定，医疗机构若使用不符合国家标准的消毒产品，或将其用于治疗疾病等超出其设计用途的行为，卫生行政部门有权责令其限期改正，并可处以罚款。罚款金额根据违法情节的严重程度而定，一般从几千元到数万元不等。
- 若医疗机构未取得《医疗机构执业许可证》而擅自开展诊疗活动，包括使用消毒产品治疗疾病，还将面临更严厉的处罚，如没收违法所得、没收药品器械，并处以违法所得五倍以上二十倍以下的罚款（若违法所得不足一万元，则按一万元计算）。
刑事责任：
- 在极端情况下，如果医疗机构使用消毒产品治疗疾病导致患者重伤、死亡或其他严重后果，且该行为构成犯罪的，相关责任人员将依法承担刑事责任。例如，可能构成非法行医罪或过失致人重伤（死亡）罪等。
建议：医疗机构应严格遵守相关法律法规，确保使用的消毒产品符合国家标准，并仅用于其设计用途，如环境消毒、物品消毒等，而非直接用于治疗疾病。如有任何疑问或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询。