当在刑事拘留过程中发现女性嫌疑人怀孕时，我国法律体系有一系列严谨且人性化的处理措施来确保法律的严肃性，同时充分保护妇女和胎儿的权益。以下是详细的处理流程和相关法律知识点：

一、变更强制措施

法律依据： 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第六十七条，对于怀孕或者正在哺乳自己婴儿的妇女，如果采取取保候审不致发生社会危险性，那么可以取保候审。

实施流程：

1. 公安机关在发现被拘留的妇女怀孕或正在哺乳后，应立即向人民检察院报告进行审查。
2. 检察院在审查确认后，会建议公安机关变更强制措施。通常，这会将刑事拘留变更为取保候审或监视居住。

取保候审与监视居住的具体内容：

• 取保候审：犯罪嫌疑人需要提供保证人或交纳保证金，之后可以回家等候审判，从而避免继续被羁押。
• 监视居住：如果犯罪嫌疑人无法提出保证人或交纳保证金，根据《刑事诉讼法》第七十四条，可以限制其在特定的居住场所内活动。与看守所羁押相比，这种方式对人身自由的限制较小。

二、刑罚执行方面的特别规定

缓刑适用： 根据《中华人民共和国刑法》第七十二条，如果怀孕的妇女被判处拘役或三年以下有期徒刑，并且符合一定条件（如犯罪情节较轻、有悔罪表现等），那么应当宣告缓刑，以避免其实际服刑。

暂予监外执行： 如果怀孕妇女被判有期徒刑或拘役，根据《刑事诉讼法》第二百六十五条，可以暂予监外执行。这意味着她可以在监外生产和生活，哺乳期满后，再根据刑期情况决定是否继续收监。

三、保障合法权益与特殊照顾

在整个刑事诉讼过程中，应充分保障怀孕妇女的合法权益，这包括她的人身安全、健康权以及公正审判权。特别需要关注她的身体状况和特殊需求，避免任何可能对其身体或胎儿造成伤害的行为。

特别关注与照顾的具体措施：

• 在羁押期间，为怀孕妇女提供适当的医疗服务和营养支持。
• 关注她的心理健康状况，必要时提供心理咨询或治疗服务。

四、法律程序的继续进行

尽管因怀孕而变更了强制措施，但刑事诉讼程序并不会因此中止。案件将继续进行调查、审理，并根据事实和证据作出法律判决。如果怀孕妇女被判定有罪，法院在考虑刑罚时会充分考虑其怀孕情况，并可能依法给予从轻或减轻处罚。

综上所述，当在刑事拘留中发现女性嫌疑人怀孕时，我国法律体系通过变更强制措施、提供特别照顾以及灵活调整刑罚执行方式，既保障了怀孕妇女的合法权益，又确保了刑事诉讼程序的顺利进行。