在存在合同纠纷时，施工单位一般无权直接拒绝竣工验收，但具体情况需根据合同条款和纠纷性质来判断。以下从不同角度为您详细分析：

1. 合同约定优先

• 若合同明确约定了竣工验收的条件和程序，且施工单位提出的纠纷（如工程款支付、设计变更等）并不构成拒绝验收的合法理由，则施工单位应按照合同约定履行验收义务。拒绝验收可能构成违约，需承担相应的违约责任。
• 若合同中存在争议条款，如对验收标准、时间等存在模糊或争议，施工单位可以提出异议，但应通过协商、调解或诉讼等合法途径解决，而非直接拒绝验收。

2. 纠纷性质影响

• 若纠纷涉及工程质量问题，且施工单位有充分证据证明工程存在严重质量问题，可能影响验收通过，施工单位可以提出整改要求，并在整改完成后申请验收。但直接拒绝验收仍需谨慎，应依据合同和法律规定进行。
• 若纠纷为非实质性争议，如工程款支付延迟但不影响工程质量，施工单位通常无权拒绝验收。此时，施工单位应继续履行验收义务，同时通过法律途径追讨工程款。

3. 法律后果与风险

• 拒绝验收的法律后果：施工单位拒绝验收可能导致发包方依据合同约定或法律规定，自行组织验收或委托第三方验收，并可能扣除相应违约金或赔偿损失。此外，拒绝验收还可能影响工程款的结算和支付。
• 建议与风险防范：在存在合同纠纷时，施工单位应首先评估纠纷的性质和影响，判断是否构成拒绝验收的合法理由。若认为有必要拒绝验收，应提前与发包方沟通，并依据合同和法律规定提出合理诉求。同时，施工单位应保留相关证据，以备后续法律纠纷之需。

4. 实际操作建议

• 沟通协商：在存在合同纠纷时，施工单位应首先与发包方进行沟通协商，寻求双方都能接受的解决方案。这有助于避免矛盾升级，减少法律纠纷的风险。
• 法律途径：若沟通协商无果，施工单位可以通过法律途径解决纠纷，如提起诉讼或申请仲裁。在诉讼或仲裁过程中，施工单位应依据合同和法律规定提出诉求，并提交相关证据支持自己的主张。

总结来说，在存在合同纠纷时，施工单位应谨慎对待竣工验收问题。除非合同明确约定或法律有特别规定，否则施工单位通常无权直接拒绝验收。若认为有必要拒绝验收，应提前与发包方沟通，并依据合同和法律规定提出合理诉求。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。