行政处罚裁量基准一般由设区的市级以上人民政府及其部门根据实际情况制定并公布，具体层次可能因行政处罚种类和地区差异而有所不同。以下是对此问题的详细分析：

1. 制定主体与层次：

   • 设区的市级以上人民政府及其部门：根据《中华人民共和国行政处罚法》的相关规定，行政处罚的裁量基准通常由设区的市级以上人民政府及其部门负责制定。这些基准旨在规范行政处罚的裁量权，确保行政处罚的公正性和合理性。
   • 不同行政处罚种类的差异：对于某些特定的行政处罚种类，如限制人身自由的行政处罚，其裁量基准可能由更高层级的政府或部门制定。这是因为这些处罚对公民权利的影响更为重大，需要更为严格的规范和监督。

2. 制定程序与公开性：

   • 制定程序：行政处罚裁量基准的制定应当遵循法定程序，包括起草、征求意见、审查、决定和公布等环节。这些程序旨在确保裁量基准的合法性和合理性，防止滥用裁量权。
   • 公开性：行政处罚裁量基准制定后，应当及时向社会公布，以便公众了解和监督。公开性是确保行政处罚公正性和透明度的重要手段。

3. 地区差异与灵活性：

   • 地区差异：由于不同地区的经济发展水平、社会文化背景等因素存在差异，因此行政处罚裁量基准的制定也可能存在地区差异。这种差异体现了行政处罚的灵活性和适应性，有助于更好地满足当地实际需求。
   • 灵活性：在制定行政处罚裁量基准时，应当充分考虑当地实际情况，确保基准的合理性和可行性。同时，也应当保持一定的灵活性，以便根据实际情况进行调整和优化。

4. 实际应用与监督：

   • 实际应用：行政处罚裁量基准在实际应用中应当得到严格遵守和执行。行政机关在行使裁量权时，应当依据裁量基准进行裁量，确保行政处罚的公正性和合理性。
   • 监督机制：为了确保行政处罚裁量基准的有效实施，应当建立健全的监督机制。这包括内部监督、外部监督以及社会监督等多种形式，以便及时发现和纠正裁量权滥用等问题。

建议：若您对行政处罚裁量基准的具体内容或制定程序有进一步疑问，或在实际操作中遇到相关问题，可以直接向我咨询。我将结合您的具体情况，提供更为详细和专业的法律建议。