怀孕旷工被开除的合法性需根据具体情况判断。若孕妇确实严重违反了合法有效的用人单位规章制度，且旷工事实清楚，用人单位的开除行为是合法的；反之，若规章制度不合理、不合法，或孕妇有合理理由未出勤，则开除行为不合法。

详细分析如下：

一、合法开除的情形

1. 规章制度合法有效：

   • 用人单位的规章制度必须经过民主程序制定，并已向劳动者公示或告知。例如，规章制度中明确规定“员工连续旷工3天或累计旷工5天属于严重违纪，可解除劳动合同”，且该制度已经职工代表大会讨论通过并公示。

2. 旷工事实清楚：

   • 用人单位必须有充分的证据证明孕妇存在旷工行为，如考勤记录、请假审批记录等。若孕妇确实无正当理由多次未出勤，且达到了规章制度中规定的旷工标准，则用人单位有权依据规章制度解除劳动合同。

3. 法律依据明确：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条，劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。这一规定并未将孕妇排除在外。

二、不合法开除的情形

1. 规章制度不合法：

   • 如果用人单位的规章制度没有经过民主程序制定，或内容违反了法律法规的强制性规定，那么该规章制度就不能作为解除劳动合同的依据。此时，即使孕妇存在旷工行为，用人单位也不能依据该规章制度将其开除。

2. 孕妇有合理理由未出勤：

   • 如果孕妇因特殊原因（如孕期反应、产检等）未能出勤，且已经提前向用人单位请假或说明了情况，那么用人单位就不能以旷工为由将其开除。

综上所述，怀孕旷工被开除的合法性取决于多个因素，包括用人单位的规章制度是否合法有效、孕妇的旷工行为是否事实清楚以及是否存在合理理由未出勤等。因此，在处理此类案件时，需要综合考虑各种因素并依据相关法律法规进行判断。如有进一步需要，您可以继续咨询我。