代持协议可以做公证书。以下是对此问题的详细分析：
一、代持协议公证的法律依据与可行性
法律未禁止公证：我国法律并未明确禁止对代持协议进行公证。根据《中华人民共和国公证法》的相关规定，合同（包括代持协议）属于可以公证的事项之一。因此，从法律层面来看，代持协议是可以进行公证的。
公证的作用：公证机构作为专业的法律服务机构，可以对代持协议的真实性、合法性进行审查，并出具公证书。这有助于增强协议的证明力，降低法律风险，并在发生纠纷时提供有力的证据支持。
二、代持协议公证的条件
真实性与合法性：代持协议必须真实、合法，不得违反法律法规的强制性规定，也不得损害国家、集体或第三人的利益。否则，公证机构将不予公证。
双方自愿：代持协议的公证需要双方当事人自愿申请，并共同到公证处办理公证手续。任何一方不得强迫另一方进行公证。
材料齐全：申请公证时，当事人需要提交相关证明材料，如身份证明、代持协议文本、公司相关资料（如公司章程、股东名册等）以及其他辅助材料（如婚姻状况证明、转账证明等）。这些材料应当真实、有效，并符合公证机构的要求。
三、代持协议公证的流程
准备材料：包括代持协议文本、双方身份证明、公司相关资料以及其他辅助材料。
选择公证处：根据《中华人民共和国公证法》的规定，当事人可以向住所地、经常居住地、行为地或者事实发生地的公证机构提出申请。选择具有公证资质的公证处进行办理，确保公证的合法性和有效性。
申请与受理：在公证处填写公证申请表，详细、如实说明申请公证事项的有关情况，并提供真实、合法、充分的证明材料。公证机构对提交的材料进行初步审查，确认材料齐全、内容符合要求后，决定受理并向申请人发送受理通知单。申请人需按规定缴纳公证费用。
核实与调查：公证机构通过多种方式对申请人提供的材料进行核实，如向有关单位或个人进行调查核实，查询相关登记信息等。同时，公证员会就代持协议的相关内容对双方当事人进行询问，了解协议签订的背景、双方的真实意思表示等情况，并制作询问笔录，由当事人签字确认。
出具公证书：公证员完成核实和调查工作后，将相关材料和意见报公证机构的审批人员进行审批。经审批通过后，公证机构在规定的期限内（一般为15个工作日内，特殊情况除外）出具公证书。公证书明确记载代持协议的内容，并证明该协议的签订行为符合法律规定，是双方当事人的真实意思表示。
四、代持协议公证的效力与风险
公证效力：经过公证的代持协议具有更强的证明力。在发生纠纷时，公证书可以作为认定案件事实的重要依据。同时，公证还可以在一定程度上预防纠纷的发生，维护当事人的合法权益。
潜在风险：尽管代持协议可以进行公证，但公证并不能完全消除代持行为本身存在的法律风险。例如，如果名义股东擅自处分股权或滥用股东权利，实际出资人可能面临权益受损的风险。因此，在选择代持方式时，当事人应充分了解相关法律规定和潜在风险，并采取必要的措施来防范风险。
五、注意事项
总结来看，代持协议是可以进行公证的，但需满足一定条件并遵循相应的流程。如果你有进一步的法律问题或需要具体的法律建议，可以直接向我咨询。