结论：员工借支两万六千块后失踪，并不一定构成诈骗，是否构成诈骗需根据具体情况和证据来判断。以下从不同角度进行分析：
一、诈骗罪的构成要件
诈骗罪是指以非法占有为目的，用虚构事实或者隐瞒真相的方法，骗取数额较大的公私财物的行为。构成诈骗罪需要满足以下几个要件：
- 主观方面：具有非法占有的目的，即行为人意图通过欺骗手段非法获取他人财物。
- 客观方面：实施了虚构事实或隐瞒真相的行为，使被害人产生错误认识，并基于这种错误认识处分了财物。
- 数额要求：诈骗的财物数额需要达到一定的标准，根据《刑法》及相关司法解释，诈骗公私财物价值三千元至一万元以上、三万元至十万元以上、五十万元以上的，应当分别认定为刑法第二百六十六条规定的“数额较大”、“数额巨大”、“数额特别巨大”。
二、员工借支后失踪的具体分析
若员工有非法占有目的：
- 如果员工在借支时就有非法占有的目的，即明知自己无力偿还或根本不打算偿还，而虚构事实或隐瞒真相（如虚构借款用途、隐瞒真实身份等）骗取公司财物，且数额达到诈骗罪的立案标准，则可能构成诈骗罪。
若员工无非法占有目的：
- 如果员工在借支时并无非法占有的目的，而是由于后续原因（如突发疾病、意外事件、经营失败等）导致无力偿还，且没有实施虚构事实或隐瞒真相的行为，则一般不构成诈骗罪。这种情况下，员工的行为可能更倾向于民事纠纷中的借贷纠纷或违约行为。
三、法律建议
收集证据：
- 公司应尽快收集与员工借支相关的所有证据，包括借支申请、审批记录、转账凭证、员工身份信息、联系方式等。
- 如果可能，还应收集员工失踪前的相关行为证据，如工作表现、财务状况、社交活动等，以判断其是否有非法占有的目的。
报警处理：
- 如果公司怀疑员工构成诈骗罪，应及时向公安机关报案，并提供相关证据。
- 公安机关将根据证据情况决定是否立案侦查，并依法追究犯罪嫌疑人的刑事责任。
民事诉讼：
- 如果员工的行为不构成诈骗罪，但确实存在借贷纠纷或违约行为，公司可以通过民事诉讼途径追讨欠款。
- 在民事诉讼中，公司需要提供充分的证据证明员工借支的事实、金额以及未偿还的情况。
进一步思考：在处理此类案件时，公司应注重证据的收集和保存，以便在后续的法律程序中维护自己的合法权益。同时，公司也应加强内部管理，完善借支制度，防止类似事件再次发生。如果有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。