在判决时，法院会综合考虑多个因素，包括鉴定意见的合理性、科学性以及案件的具体情况，来确定护理天数与营养天数。具体分析如下：

一. 鉴定意见的分析与比较

1. 同等级鉴定的考量：两个司法鉴定所给出的伤残等级相同，这意味着在伤残程度的认定上，两家机构达成了一致。这是判决的基础，但对于护理天数和营养天数的不同意见，则需要进一步分析。
2. 差异原因探究：法院会审查两个鉴定意见中关于护理天数和营养天数评估的具体依据、方法以及结论，探究产生差异的原因。这可能涉及伤者的具体伤情、恢复状况、医疗建议等多个方面。

二. 综合考虑案件具体情况

1. 伤者实际情况：法院会考虑伤者的年龄、体质、伤情严重程度以及恢复能力等因素，以判断哪个鉴定意见更贴近伤者的实际需求。
2. 医疗建议与证据：医疗机构的建议、治疗记录以及其他相关证据也是法院判断的重要依据。如果某份鉴定意见与医疗建议更为吻合，那么其被采纳的可能性会更高。

三. 法院的判断与裁量

1. 专业性评估：法院会依据自身的专业知识和经验，对两份鉴定意见进行专业性的评估。这包括对鉴定机构的资质、鉴定人员的专业水平以及鉴定过程的合规性等方面的考量。
2. 综合判断：在综合考虑上述因素后，法院会作出一个综合判断，确定一个更为合理、科学的护理天数和营养天数。这个判断会基于案件的具体情况，力求实现公平与正义。

我建议：在面临此类情况时，当事人可以积极向法院提供相关证据和材料，以支持自己的主张。同时，也可以考虑聘请专业的医疗纠纷律师，以提供更专业的法律意见和代理服务。如有进一步需要，您可以继续咨询我。