双方身份不明确达成的协议，其有效性需视具体情况而定。以下是对此问题的详细分析：
一. 协议有效性的判断标准
民法典的相关规定：根据《民法典》第一百四十三条，具备下列条件的民事法律行为有效：行为人具有相应的民事行为能力；意思表示真实；不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。这是判断协议有效性的基本标准。
身份明确性的要求：虽然法律并未直接规定协议双方身份必须明确，但身份的不明确可能导致协议在履行过程中产生争议，甚至影响协议的有效性。例如，如果双方身份不明确，可能无法确定双方是否具有相应的民事行为能力，进而影响协议的有效性。
二. 身份不明确对协议有效性的影响
可能影响真实意思表示：如果双方身份不明确，可能无法准确判断双方是否真实、自愿地表达了意思，从而影响协议的有效性。例如，一方可能利用身份不明确进行欺诈或胁迫，导致另一方在非自愿的情况下签订协议。
可能影响协议履行：身份不明确可能导致在协议履行过程中出现无法确定权利义务主体的情况，进而影响协议的履行和效力。例如，如果双方身份不明确，当协议需要履行时，可能无法找到具体的履行方，导致协议无法履行。
三. 特殊情况的考虑
匿名或化名签订协议：在某些情况下，双方可能使用匿名或化名签订协议。这种情况下，如果双方均认可协议内容，且协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么协议仍然可能有效。但一旦发生争议，解决起来可能更加困难。
电子合同中的身份认证：在电子合同中，双方的身份可能通过数字签名、电子认证等方式进行确认。虽然这种方式下的身份可能不是传统意义上的“明确”，但只要能够确保双方身份的真实性和可验证性，协议仍然可以认为是有效的。
综上所述，双方身份不明确达成的协议，其有效性需根据具体情况判断。如果双方均具备民事行为能力，意思表示真实，且协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么协议可能仍然有效。但身份的不明确可能增加协议履行和争议解决的风险。因此，我建议在签订协议时，双方应尽可能明确自己的身份，以确保协议的有效性和履行性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。