政府采购合同的审核与招标文件的不同，并不直接导致合同无效。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、政府采购合同与招标文件的关系

政府采购合同是采购人与中标供应商之间，就采购项目达成的具有法律效力的协议。而招标文件则是采购人为了选择中标供应商而制定的，包含采购需求、投标要求、评标标准等内容的文件。招标文件是合同形成的基础，但合同内容并不完全等同于招标文件。在合同签订过程中，双方可能会根据实际情况对招标文件中的某些条款进行协商和调整。

二、合同审核与招标文件不同的原因及合法性

1. 合同内容的调整：在合同签订过程中，采购人和中标供应商可能会根据项目的实际情况、市场变化或双方协商的结果，对招标文件中的某些条款进行修改或补充。这种调整是合法的，只要修改后的合同内容不违反法律法规的强制性规定，不损害国家利益、社会公共利益和他人合法权益。

2. 审核的重点：合同审核的主要目的是确保合同内容合法、合规、合理，并保护双方的合法权益。审核过程中，可能会发现招标文件中存在的不明确、不合理或违法的内容，并在合同中进行修正。这种修正并不意味着合同无效，而是对合同内容的完善和优化。

三、合同无效的情形

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同无效的情形主要包括：

1. 无民事行为能力人实施的民事法律行为；
2. 行为人与相对人以虚假的意思表示实施的民事法律行为；
3. 违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为（但是，该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外）；
4. 违背公序良俗的民事法律行为；
5. 行为人与相对人恶意串通，损害他人合法权益的民事法律行为。

政府采购合同的审核与招标文件的不同，并不属于上述合同无效的情形。因此，不能仅凭合同审核与招标文件存在不同就认定合同无效。

四、建议与注意事项

1. 确保合同内容合法合规：在合同签订过程中，双方应确保合同内容不违反法律法规的强制性规定，不损害国家利益、社会公共利益和他人合法权益。

2. 明确合同条款：合同条款应明确、具体，避免出现模糊、歧义或容易引发争议的内容。

3. 保留相关证据：在合同签订和履行过程中，双方应保留好相关证据，如招标文件、投标文件、合同文本、往来函件等，以备不时之需。

4. 及时咨询专业律师：如果在合同签订或履行过程中遇到法律问题或争议，建议及时咨询专业律师，以维护自身合法权益。

如有任何关于政府采购合同或招标文件的法律问题，欢迎直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律建议。