开庭时，若被告代理人不合法，并不直接导致按缺席审判处理。以下是对此问题的详细分析：
一、代理人不合法的法律后果
代理人资格问题：在诉讼中，代理人必须具备合法的代理资格。若代理人不合法，如未获得被告的明确授权、代理权限超出范围或代理人本身不具备法律规定的代理资格等，这可能会影响其代理行为的效力。
法院审查义务：法院在受理案件时，会对代理人的资格进行审查。若发现代理人不合法，法院可能会要求被告更换合法的代理人，或者对代理人的行为进行限制，以确保诉讼的公正性和合法性。但这并不直接等同于缺席审判。
二、缺席审判的适用条件
被告经传票传唤，无正当理由拒不到庭：这是缺席审判的一种常见情形。若被告在收到法院的传票后，无正当理由拒绝出庭，法院可能会进行缺席审判。
被告未经法庭许可中途退庭：在庭审过程中，若被告未经法庭许可擅自退庭，法院也可能视情况决定进行缺席审判。
其他法定情形：根据相关法律法规，还可能存在其他导致缺席审判的情形，如被告死亡且无继承人或继承人放弃诉讼权利等。但代理人不合法并不属于这些法定情形之一。
三、代理人不合法时的处理方式
更换代理人：若法院发现代理人不合法，通常会要求被告更换合法的代理人。被告应在规定的时间内提供新的合法代理人信息，以确保诉讼的顺利进行。
限制代理人行为：在代理人不合法但被告又无法及时更换代理人的情况下，法院可能会对代理人的行为进行限制，如限制其发言、提交证据等，以防止其对诉讼造成不当影响。但这并不意味着会直接进行缺席审判。
保障被告诉讼权利：无论代理人是否合法，法院都有义务保障被告的诉讼权利。若因代理人不合法导致被告无法充分行使诉讼权利，法院应采取相应措施予以补救，如提供法律援助、延长举证期限等。
四、建议
确保代理人合法：被告在委托代理人时，应确保代理人具备合法的代理资格，并明确代理权限和范围，以避免因代理人不合法而影响诉讼的顺利进行。
积极应诉：无论代理人是否合法，被告都应积极应诉，配合法院的审理工作。若因特殊原因无法出庭或更换代理人，应及时向法院说明情况并申请延期审理或提供其他解决方案。
寻求法律帮助：若被告对诉讼程序或代理人的选择存在疑问，可及时咨询专业律师以获取法律帮助和指导。
综上所述，开庭时若被告代理人不合法，并不直接导致按缺席审判处理。法院会根据具体情况采取相应的处理措施，以确保诉讼的公正性和合法性。