结论前置：实习期当天辞职，第三天凌晨离开，公司扣一个月工资的做法不合法。

法律分析

1. 工资支付规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者提供了正常劳动，用人单位应当按照劳动合同约定的标准支付工资。实习期虽然不同于正式的劳动合同期，但劳动者同样有权获得与其提供的劳动相对应的报酬。
   • 劳动者辞职，并不影响其已经提供劳动部分的工资支付。公司无权因劳动者辞职而扣除其全部或部分工资，除非有明确的合同约定或法律规定，且这种约定或规定不得违反法律的强制性规定。

2. 辞职与工资扣除的关系：

   • 劳动者在实习期内辞职，是其行使劳动权的一种表现。除非劳动者给用人单位造成了实际损失，且这种损失与劳动者的辞职行为有直接因果关系，否则用人单位无权扣除劳动者的工资。
   • 即使劳动者辞职给用人单位带来了一定的不便或损失，用人单位也只能通过合法途径（如要求劳动者赔偿实际损失）来维护自己的权益，而不能随意扣除劳动者的工资。

3. 公司的违法行为：

   • 在本案例中，公司扣一个月工资的做法显然违反了上述规定。劳动者当天辞职，第三天凌晨离开，虽然时间较短，但只要其提供了正常劳动，就有权获得相应的工资。
   • 公司无权因劳动者辞职而扣除其全部工资，这种做法侵犯了劳动者的合法权益。

法律建议

1. 与用人单位协商：

   • 劳动者可以首先尝试与用人单位进行协商，要求用人单位按照法律规定支付其应得的工资。

2. 向劳动监察部门投诉：

   • 如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，要求劳动监察部门对用人单位的违法行为进行调查和处理。

3. 申请劳动仲裁或提起诉讼：

   • 如果劳动监察部门的处理结果不能满足劳动者的要求，劳动者还可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，或者向人民法院提起诉讼，通过法律途径来维护自己的合法权益。

总结：实习期当天辞职，第三天凌晨离开，公司扣一个月工资的做法是不合法的。劳动者有权获得与其提供的劳动相对应的报酬，公司无权因劳动者辞职而扣除其全部或部分工资。如果遇到这种情况，劳动者可以通过与用人单位协商、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等途径来维护自己的合法权益。如果有任何法律问题，可以直接向我咨询。