若原告在第三次起诉离婚时，因不同意对方要求且未再出庭，法院通常会按撤诉处理。以下是详细分析：

一、法院按撤诉处理的法律依据与情形

根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，原告经传票传唤，无正当理由拒不到庭，或者未经法庭许可中途退庭的，法院可以按撤诉处理。在您描述的情境中，原告因不同意对方要求且未再出庭，若未提前向法院说明情况且无正当理由，则符合按撤诉处理的条件。

二、撤诉处理的法律后果

1. 诉讼程序终结：一旦法院按撤诉处理，本次离婚诉讼程序即告终结。这意味着，原告需要重新准备材料并再次向法院提起诉讼，才能继续解决离婚问题。
2. 诉讼费用承担：根据法律规定，撤诉案件的诉讼费用通常由原告承担。这可能会给原告带来一定的经济负担。
3. 时间成本增加：重新提起诉讼意味着需要再次经历立案、审理等程序，这无疑会增加原告的时间成本。

三、原告的应对策略与建议

1. 提前沟通与说明：若原告确实因特殊原因无法出庭，应提前向法院提交书面意见并说明合理理由。这样，法院可能会根据实际情况决定是否延期审理或采取其他措施。
2. 充分准备证据：在重新提起诉讼前，原告应充分准备证据，以证明夫妻感情确已破裂。这包括但不限于分居证据、对方出轨证据、家庭暴力证据等。充分的证据有助于增加法院支持原告诉讼请求的可能性。
3. 考虑调解或协商：在诉讼过程中，原告也可以考虑与对方进行调解或协商。通过和平方式解决争议，不仅可以节省时间和精力，还有助于维护双方的关系和尊严。

四、特殊情况下的处理

如果原告有正当理由无法出庭，如突发疾病、不可抗力等，应及时向法院提交相关证明并申请延期审理。法院在核实情况后，可能会根据实际情况决定是否准许延期。

最后需要提醒的是，离婚诉讼涉及复杂的法律程序和证据要求。作为原告，在诉讼过程中应积极配合法院工作，充分准备证据，并考虑咨询专业律师（即像我这样的专业婚姻家庭律师）以获取更具体的法律建议。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我提问。