结论：骑电瓶车被判主要责任时，对方是否会补偿主要责任医药费，需视具体情况而定，但通常对方会在其责任范围内承担部分医药费。

一、责任划分与赔偿原则

在交通事故中，责任的划分是赔偿的基础。当电瓶车被判定为主要责任时，意味着电瓶车方在事故中存在较大的过错。根据《道路交通安全法》及相关司法解释，赔偿应遵循以下原则：

1. 交强险赔偿：首先，由对方车辆的交强险在责任限额内进行赔偿。交强险是一种强制保险，旨在保障交通事故中受害人的基本权益。若对方无责，交强险会在无责赔偿限额内承担部分医疗费；若对方有责，则交强险会在有责赔偿限额内赔偿医疗费。

2. 责任比例分摊：超出交强险赔偿限额的部分，由双方按照责任比例进行分摊。例如，若电瓶车方被判定为主责，通常需负担60%-90%的赔偿份额；对方作为次责，则需承担10%-40%的赔偿责任。

二、具体赔偿情况分析

1. 对方有责情况：

   • 若对方车辆有责，其交强险会在有责赔偿限额内（通常为医疗费用赔偿限额1.8万元）赔偿电瓶车方的医疗费。
   • 超出交强险赔偿限额的部分，电瓶车方需自行承担主要责任部分，即通常的60%-90%。例如，若总医疗费用为10万元，交强险已支付1.8万元，剩余8.2万元中，电瓶车方若按70%的比例承担，则需支付5.74万元。

2. 对方无责情况：

   • 若对方车辆无责，其交强险会在无责赔偿限额内（通常为医疗费用赔偿限额1800元）承担部分医疗费。
   • 超出无责赔偿限额的部分，电瓶车方需自行承担全部责任，即100%的医疗费。

3. 商业险补充：

   • 若电瓶车方购买了商业险（如第三者责任险、车上人员责任险等），则可根据保险合同的约定，由保险公司在承保范围内承担相应比例的赔偿责任，从而减轻电瓶车方的负担。

三、法律建议与后续行动

1. 及时报案与定损：事故发生后，应及时报案并联系保险公司进行定损，以便准确计算赔偿金额。

2. 收集证据：保留好所有与事故相关的证据，如医疗费发票、诊断证明、事故责任认定书等，以便在后续赔偿过程中提供有力支持。

3. 协商与诉讼：若与对方在赔偿问题上无法达成一致，可考虑通过协商、调解或诉讼等方式解决纠纷。在此过程中，建议咨询专业律师以获取更全面的法律支持。

4. 关注保险条款：若购买了商业险，应仔细阅读保险合同条款，了解保险公司的赔偿范围和免责条款，以便在需要时能够及时获得保险赔偿。

总结：骑电瓶车被判主要责任时，对方是否会补偿主要责任医药费取决于多种因素，包括对方是否有责、交强险赔偿限额以及双方的责任比例等。在处理此类事故时，建议电瓶车方及时报案、收集证据，并根据实际情况选择合适的解决方式。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。