结论：被人骗股入在个人名下的工厂倒闭两年后，能否追回投资款取决于多种因素，包括是否存在欺诈行为、证据是否充分、诉讼时效是否已过等。以下从不同角度为您详细分析。
一、是否存在欺诈行为
若存在欺诈：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，一方以欺诈手段，使对方在违背真实意思的情况下实施的民事法律行为，受欺诈方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。因此，如果您能证明对方在让您入股时存在欺诈行为（如虚构事实、隐瞒真相等），您有权要求撤销入股行为，并追回投资款。
- 建议：收集并保存所有与入股相关的证据，包括合同、转账记录、聊天记录、证人证言等，以证明对方存在欺诈行为。
若不存在欺诈：
- 如果对方不存在欺诈行为，而是由于市场风险、经营不善等原因导致工厂倒闭，那么您作为股东，通常需要承担相应的投资风险，难以直接追回投资款。
- 例外情况：如果工厂在清算过程中存在违法行为（如隐匿财产、虚假清算等），您可能有机会通过法律途径追回部分或全部投资款。
二、证据是否充分
- 无论是否存在欺诈行为，证据都是决定您能否追回投资款的关键因素。您需要提供充分的证据来证明您的主张，包括入股协议、转账记录、工厂的经营状况、清算报告等。
- 建议：尽快收集并整理相关证据，必要时可以寻求专业律师的帮助，以确保证据的完整性和有效性。
三、诉讼时效是否已过
- 根据《中华人民共和国民法典》的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
- 分析：如果工厂倒闭已经两年，但您是在最近才得知自己被骗入股或工厂存在违法行为，那么诉讼时效可能尚未过期。然而，如果自工厂倒闭之日起已经超过三年，且您在此期间未采取任何法律行动，那么诉讼时效可能已经过期，您将难以通过法律途径追回投资款。
- 建议：尽快咨询专业律师，了解诉讼时效的具体情况，并采取相应的法律行动。
四、其他可能的法律途径
- 股东代表诉讼：如果工厂存在违法行为且损害了股东的利益，您可以考虑提起股东代表诉讼，要求工厂或相关责任人承担赔偿责任。
- 破产清算程序：如果工厂已经进入破产清算程序，您可以作为债权人参与清算分配，但通常只能按照清算顺序获得部分或全部投资款的返还。
总结与建议：被人骗股入在个人名下的工厂倒闭两年后能否追回投资款，取决于是否存在欺诈行为、证据是否充分、诉讼时效是否已过等多种因素。建议您尽快收集并整理相关证据，咨询专业律师，了解具体的法律途径和诉讼时效情况，并采取相应的法律行动。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。