针对您提出的“如果烟被快递公司扣了，并不是被烟草公司扣了，怎么赔偿”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，香烟作为限制邮寄物品，在快递过程中是有严格数量限制的。根据《中华人民共和国烟草专卖法》以及国家烟草专卖局的相关规定，居民个人每次邮寄香烟的数量不得超过两条（20盒），并且只能通过陆路运输。这是为了维护烟草市场的秩序，防止非法运输和销售烟草制品。

如果您的香烟在快递过程中被快递公司扣留，且并非因为烟草公司的查扣，那么赔偿问题需要依据您与快递公司之间的服务合同以及相关法律法规来处理。一般来说，快递公司会在其服务条款中明确对于邮寄违禁品或超量物品的处理方式，包括扣留、没收或退回等，并可能规定相应的赔偿责任。

赔偿处理步骤：

1. 查看服务合同：

   • 首先，您需要仔细查阅与快递公司签订的服务合同或快递单上的条款，了解快递公司对于邮寄违禁品或超量物品的具体处理规定。

2. 联系快递公司：

   • 如果您的香烟被扣留，您应立即联系快递公司，了解扣留的具体原因，并询问赔偿的相关事宜。快递公司可能会要求您提供相关证据，如购买凭证、邮寄记录等。

3. 协商赔偿：

   • 根据服务合同和实际情况，与快递公司协商赔偿方案。如果快递公司承认其存在过错或违约行为，可能会按照合同约定或法律规定进行赔偿。赔偿方式可能包括退还邮费、赔偿香烟价值或提供其他补偿措施。

4. 法律途径：

   • 如果与快递公司协商无果，您可以考虑通过法律途径维护自己的权益。您可以向当地消费者协会投诉，或者向法院提起诉讼，要求快递公司承担相应的赔偿责任。

特别提醒：

• 如果您的香烟邮寄数量超过了法定限制，那么快递公司扣留您的香烟可能是合法的，此时您可能难以获得全额赔偿。
• 在邮寄香烟时，请务必遵守相关法律法规和快递公司的规定，以免给自己带来不必要的麻烦和损失。

综上所述，如果您的香烟被快递公司扣留且并非因为烟草公司的查扣，赔偿问题需要依据您与快递公司之间的服务合同以及相关法律法规来处理。建议您先查看服务合同、联系快递公司并协商赔偿方案，如果协商无果再考虑通过法律途径维护自己的权益。