结论：违法用地拆除复耕整改到位后是否需要立案，需结合违法性质、整改效果、法律程序要求及行政机关的裁量权综合判断，具体分以下情况：

1. 若违法用地行为已构成行政违法，且法律明确要求立案的，整改到位不影响立案程序

根据《土地管理法》《城乡规划法》等法律，违法用地行为（如未经批准占用土地、擅自改变土地用途等）属于行政违法行为，行政机关（如自然资源部门）需依法履行立案、调查、处罚等程序。即使当事人已自行拆除违法建筑并复耕，行政机关仍需立案调查，确认违法事实、整改效果是否符合要求，并依法作出行政处罚决定（如罚款、没收违法所得等）。
法律依据：

• 《土地管理法》第七十七条：未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状。
  
• 《行政处罚法》第五十七条：调查终结，行政机关负责人应当对调查结果进行审查，根据不同情况作出行政处罚决定。
  

2. 若违法情节轻微且已整改到位，行政机关可依法不予处罚或终止案件

根据《行政处罚法》第三十三条，违法行为轻微并及时改正，没有造成危害后果的，不予行政处罚；初次违法且危害后果轻微并及时改正的，可以不予行政处罚。若违法用地行为符合上述情形（如占用面积小、未破坏耕地种植条件、已主动复耕且未造成其他损害），行政机关经调查后，可依法作出不予处罚决定或终止案件。
关键点：

• 需行政机关通过立案调查确认“违法情节轻微”及“整改到位”的事实；
  
• 当事人需提供复耕证明（如现场照片、第三方检测报告等）辅助证明。
  

3. 若涉及刑事犯罪（如非法占用农用地罪），整改不影响刑事立案

根据《刑法》第三百四十二条，违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏的，构成非法占用农用地罪。即使当事人已拆除建筑并复耕，若其违法行为已达到刑事立案标准（如占用基本农田5亩以上或基本农田以外的耕地10亩以上），公安机关仍需依法立案侦查，追究刑事责任。
法律依据：

• 《刑法》第三百四十二条：非法占用农用地罪；
  
• 《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（一）》第六十七条：非法占用农用地罪的立案标准。
  

4. 行政机关未立案的，当事人可申请行政复议或提起行政诉讼

若行政机关对符合立案条件的违法用地行为未依法立案，或对整改效果认定错误，当事人可依法申请行政复议（向上一级行政机关提出）或提起行政诉讼（向法院起诉），要求行政机关履行法定职责或纠正错误决定。

建议：

• 若您涉及违法用地整改，需主动联系当地自然资源部门，配合调查并提交复耕证明；
  
• 若对行政机关的处理决定有异议，可携带相关材料（如整改照片、行政决定书等）向我进一步咨询，我将结合具体案情分析维权路径。