申请公司律师（这里理解为聘请公司法律顾问）的好处主要体现在以下几个方面：

1. 健全企业内部运行机制：

   • 企业要合理运作、正常发展，需要有一系列健全的运营机制。企业管理者可能是经营方面的专家，但对于内部风险防范可能不够专业。例如，有的企业公章和合同管理机制不健全，导致员工有机会滥用权力，签订合同内容无监控，最终可能引发合同履行问题，甚至出现员工利用管理漏洞联合第三方损害公司利益的情况。聘请公司律师后，他们可以协助企业建立健全的管理机制，防范内部风险。

2. 参与日常经营，提示风险：

   • 公司在日常经营中需要不断与外界进行交易，这些交易通过谈判协商、签订合同来确定。在这个过程中，交易双方的权利义务此消彼长，既存在发展利益，也可能存在陷阱和危机。公司律师可以参与谈判，审理合同，提示法律风险，确保合同内容合法合规，保护公司利益。例如，在合同签订过程中，律师可以审查合同条款，避免不公平或违法的条款，确保公司权益不受损害。

3. 分析法律风险，合法操作：

   • 当公司发展到一定程度，可能需要通过联营、兼并、分立或投资等方式来达到新的发展层次。这些方式都不同于单笔交易，涉及公司下一步的发展方向，可能动用公司大量资金。由于缺乏风险意识，有时公司的利益会受到重大损害。公司律师可以分析这些过程中的法律风险，提供合法操作建议，确保公司决策合法合规，避免潜在的法律纠纷。

4. 担任企业代理人，维护合法权益：

   • 在如今这个法治社会，企业很难完全避免卷入诉讼中。一旦出现纠纷，公司律师可以担任企业的代理人，参与合同纠纷等法律纠纷的调解、仲裁或诉讼活动，维护企业的合法权益。他们熟悉法律程序，能够为企业提供专业的法律支持，减少企业损失，避免对企业造成较大影响。

额外好处：

• 成本效益：对于私人、小型企业及法律事务较少的企业，常年法律顾问费相对较低，但能够提供的法律服务却非常全面，包括防范企业运营中的法律风险、设计企业常用合同文本、规范劳动关系等。对于中型企业和大企业，虽然法律顾问费相对较高，但考虑到其能够为企业带来的法律保障和风险防范效果，这笔费用也是物超所值的。
• 专业培训：公司律师还可以定期对员工进行法律知识培训，提高员工的法律意识，减少因法律知识匮乏而引发的法律风险。

综上所述，申请公司律师（聘请公司法律顾问）对于企业来说具有诸多好处，不仅能够健全企业内部运行机制、参与日常经营提示风险、分析法律风险合法操作，还能担任企业代理人维护合法权益，同时具有成本效益和专业培训等额外优势。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问。