当协议股东成为被执行人时，处理方式需依据具体情况和法律程序来进行，以下是一些详细的步骤和建议：
一、明确执行原因及法律依据
首先，股东需要弄清楚自己为何会被执行，以及这一执行行为的法律依据是什么。通常，这可能是因为公司债务问题，股东作为公司的一部分，在某些情况下可能需要承担连带责任。明确原因和依据是后续应对措施的基础。
二、全面掌握执行详情
股东应详细了解执行的各个方面，包括但不限于：
了解这些信息有助于股东判断执行是否存在不合理之处，并据此制定应对策略。
三、对执行行为提出异议
如果股东发现执行程序存在违法或不当之处，如执行法院未按照法定程序进行执行，或在执行过程中侵犯了股东的合法权益，股东有权向执行法院提出复议申请。这是维护自身权益的重要途径。
四、说明自身情况并请求解除执行措施
如果股东已经按照规定履行了自己应尽的出资义务等法定责任，那么应及时向法院说明实际情况，并提供相关证据来证明。在此基础上，请求法院解除对自己的连带执行措施。因为依法履行义务的股东不应承担不合理的责任。
五、明确责任边界
在涉及公司与股东财产混同这类复杂问题时，股东可以通过向法院提起诉讼等合法方式，明确公司和股东之间的责任界限。这有助于避免自己的财产被不合理地执行，从而保障自身财产的安全。
六、积极沟通协商
股东应主动与执行法院、申请执行人等相关方面进行沟通协商。以诚恳、理性的态度寻求一个妥善的解决办法，这有助于维护自身的合法权益，并可能促使各方达成和解。
七、法律救济途径
如果股东对执行法院的裁定不服，还可以根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，在裁定送达之日起十日内向上一级人民法院申请复议。这是法律赋予股东的救济权利，应合理利用。
概括起来，当协议股东成为被执行人时，关键在于明确执行原因及法律依据，全面掌握执行详情，对执行行为提出异议（如存在违法或不当之处），说明自身情况并请求解除执行措施（如已履行出资义务），明确责任边界（如涉及财产混同问题），以及积极沟通协商和寻求法律救济途径。这些措施将有助于股东有效应对执行问题，维护自身合法权益。