车主在一般情况下不能直接处理因高速超速扣12分且驾驶员失联的违章，但可通过合法途径协助解决。以下是对此问题的详细分析：
一、法律责任主体
根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，交通违章行为的法律责任主体是实际驾驶人，而非车辆所有人（车主）。这意味着，如果驾驶员因超速被扣12分，原则上应由驾驶员本人接受处罚并承担相应责任。
二、车主的协助义务与限制
协助义务：
- 车主有义务提供车辆的相关信息，如行驶证、车辆登记证等，以协助交通管理部门查明违章事实。
- 在驾驶员失联的情况下，车主可以积极配合交通管理部门，提供驾驶员的可能联系方式或居住地址等信息，以便交通管理部门联系驾驶员。
处理限制：
- 车主不能直接代替驾驶员接受处罚。因为处罚是针对驾驶员的违章行为，车主并非违章行为的直接责任人。
- 如果车主试图通过不正当手段（如伪造证据、冒名顶替等）为驾驶员逃避处罚，将可能面临法律责任，包括但不限于罚款、拘留等。
三、驾驶员失联的处理建议
尝试联系驾驶员：
- 车主应首先尝试通过电话、短信、社交媒体等方式联系驾驶员，告知其违章情况并督促其尽快接受处罚。
向交通管理部门说明情况：
- 如果驾驶员确实失联，车主可以向交通管理部门说明情况，并提供驾驶员的相关信息（如身份证号、驾驶证号等），以便交通管理部门进一步调查处理。
- 交通管理部门可能会根据具体情况，采取公告送达、强制执行等措施来确保违章行为得到处理。
考虑法律途径：
- 如果驾驶员长期失联且拒绝接受处罚，车主可以考虑通过法律途径解决。例如，向法院提起民事诉讼，要求驾驶员承担因违章行为给车主造成的损失（如车辆被扣留期间的损失、罚款等）。但需要注意的是，这种法律途径可能涉及复杂的法律程序和较高的成本。
四、可能的法律后果
- 如果驾驶员未按时接受处罚，交通管理部门可能会采取一系列措施，如暂扣车辆、吊销驾驶证等。这些措施将直接影响驾驶员的驾驶资格和车辆使用。
- 车主如果协助驾驶员逃避处罚，也可能面临法律责任。因此，车主应谨慎处理此类问题，避免卷入不必要的法律纠纷。
建议：车主在遇到此类问题时，应积极配合交通管理部门的工作，提供必要的信息和协助。同时，也可以考虑咨询专业律师（如我本人徐茂林律师，专注于刑事辩护、交通事故、合同纠纷领域），以获取更具体的法律建议和帮助。如果有任何法律问题，可以直接向我提问。