丈夫通过跟踪偷拍妻子出轨的证据，法院是否采纳需视具体情况而定，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

一、证据合法性角度

1. 隐私权保护：隐私权是公民的重要权利之一。未经他人同意，私自进行跟踪偷拍，很可能侵犯了他人的隐私权。如果跟踪偷拍行为本身违法，如通过非法侵入他人住宅、在私人场所安装偷拍设备等方式进行，那么所获取的证据可能会因取证手段不合法而被法院排除，不能作为认定案件事实的依据。
2. 合法取证途径：只有通过合法途径取得的证据，才会被法院采纳。例如，在公共场所合法安装的监控设备所拍摄到的出轨行为视频，或者通过合法手段（如取得对方同意后的录音录像）获取的证据，可能会被法庭采纳。这些证据需要符合关联性、合法性和真实性等要求。

二、证据关联性、真实性和合法性要求

1. 关联性：证据必须与案件事实具有关联性，即能够证明或反驳案件中的某个事实。如果跟踪偷拍所获取的证据与案件事实无直接关联，那么法院可能不会采纳。
2. 真实性：证据必须真实可靠，不能是伪造或篡改的。如果跟踪偷拍所获取的证据存在伪造或篡改的嫌疑，那么法院可能会对其真实性产生质疑，从而不予采纳。
3. 合法性：除了取证手段合法外，证据本身也不能违反法律强制性规定或公序良俗。如果跟踪偷拍所获取的证据涉及违法内容或侵犯他人合法权益，那么法院可能会认定其违法，从而不予采纳。

三、法律后果与建议

1. 法律后果：如果因为跟踪偷拍行为而导致他人的合法权益受到了侵害，那么侵权人（即跟踪偷拍者）可能需要承担相应的法律责任，包括民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。
2. 建议：在处理婚姻家庭纠纷时，当事人应保持理性，尽量通过合法途径去获取证据。例如，可以寻求律师的帮助，通过合法手段收集证据；或者与对方进行协商，达成和解协议。这样不仅能够更好地维护自身的权益，也符合法律的精神和要求。

举例说明：假设丈夫在公共场所（如商场、餐厅等）合法安装的监控设备拍摄到了妻子与他人出轨的视频，且该视频与案件事实具有关联性、真实性和合法性，那么该视频可能会被法庭采纳作为证据。但如果丈夫私自闯入妻子与他人的私人住所进行偷拍，那么所获取的证据可能会因取证手段不合法而被法院排除。

综上所述，丈夫通过跟踪偷拍妻子出轨的证据，法院是否采纳需根据具体情况进行判断。在处理此类问题时，建议当事人保持理性，通过合法途径获取证据，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。