公司法人占100%股权但不是实际出资人，依然可以按照法定程序注销公司。以下是对这一问题的详细分析：
一、注销公司的法定程序
召开股东会或股东大会：
- 依据公司章程规定的表决程序，作出公司解散的决议。这是注销公司的第一步，也是关键步骤，它决定了公司是否进入注销流程。
成立清算组：
- 清算组负责展开清算工作，包括通知债权人申报债权、清理公司财产、编制资产负债表和财产清单、处理与清算有关的未了结业务等。清算组的成立和运作是注销公司过程中不可或缺的一环。
制作清算报告：
- 完成清算后，需要制作清算报告，并经股东会、股东大会确认。清算报告是注销公司的重要依据，它反映了公司清算过程中的财务状况和清算结果。
向公司登记机关申请注销登记：
- 提交公司清算组负责人签署的注销登记申请书、人民法院的破产裁定（如适用）、解散裁判文书（如适用）、公司依照《公司法》作出的决议或者决定、清算报告等文件。经登记机关核准后，公司终止。
二、实际出资人与公司法人的关系
- 实际出资人：是指实际向公司投入资金或资产的人，他们可能是公司的隐名股东或名义股东背后的实际控制者。
- 公司法人：是指具有民事权利能力和民事行为能力，依法独立享有民事权利和承担民事义务的组织。在公司中，法人通常由股东会或股东大会选举产生，代表公司行使职权。
公司法人占100%股权，但并不意味着其必须是实际出资人。股权的持有和实际出资可能是分离的，这在实际商业操作中并不罕见。因此，即使公司法人不是实际出资人，也不影响其按照法定程序注销公司。
三、实际控制人不配合的情况
- 如果实际控制人不配合注销程序，公司法人可以通过法律途径维护自身权益，推动注销程序的进行。例如，可以提起诉讼要求实际控制人配合注销，或者通过其他合法手段解决争议。
四、法律建议
- 确保程序合法：在注销公司过程中，必须严格遵守法定程序，确保每一步都合法合规。
- 保留相关证据：在清算和注销过程中，应保留好相关证据，如清算报告、股东会决议、注销登记申请书等，以备不时之需。
- 寻求专业帮助：如果对注销程序不熟悉或遇到法律难题，建议寻求专业律师的帮助，以确保注销程序的顺利进行。
公司法人占100%股权但不是实际出资人时，依然可以按照法定程序注销公司。在注销过程中，应确保程序合法、保留相关证据，并在必要时寻求专业帮助。如果有任何法律问题或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问。