针对您提出的“公司注销股东往来款怎么处理”的问题，这是一个涉及公司清算和债权债务处理的重要环节。以下是我为您提供的详细解答：
一、公司注销前往来款的清查与分类
在公司决定注销前，必须对所有往来款进行全面清查，这包括但不限于应收账款、应付账款、其他应收款和其他应付款。清查的目的是确定每笔款项的性质、金额和可收回性（对于应收账款）或可支付性（对于应付账款）。
应收账款：
- 对能收回的款项，应及时进行催收，确保资金回笼。
- 对无法收回的款项，若符合坏账条件（如对方破产、失踪等），需取得相关证据（如破产清算证明、法院判决书等），进行坏账核销，并在税务上按规定申报扣除。
应付账款：
- 对确实需要支付的款项，应确保在注销前结清，避免留下债务隐患。
- 对无需支付的款项（如因合同取消、对方放弃债权等），应转为营业外收入，并计入企业应纳税所得额缴纳企业所得税。
其他应收款和其他应付款：
- 核实款项性质和真实性，对个人借款等情况及时清理，避免税务风险。
- 对于其他应收款，若无法收回，同样需进行坏账处理；对于其他应付款，若无需支付，则转为营业外收入。
二、公司注销时往来款的账务处理
完成往来款清查后，需进行相应的账务调整，确保账实相符。这包括：
- 编制准确的资产负债表和相关报表，反映公司注销时的财务状况。
- 对坏账进行核销处理，并调整相关会计科目。
- 对无需支付的应付账款和其他应付款，转为营业外收入，并调整应纳税所得额。
三、公司注销后往来款的后续处理
债权方面：
- 若公司注销前清算有遗漏，存在未收回的债权，股东在一定条件下可代表原公司追讨。根据相关法律，股东作为清算义务人，在公司注销后发现遗漏债权，可代表原公司追讨，追讨所得按股权比例分配。
债务方面：
- 若公司注销前存在未清偿的债务，债权人可要求公司股东、发起人或出资人承担清偿责任。特别是当公司未经依法清算即办理注销登记时，股东或第三人在公司登记机关办理注销登记时承诺对公司债务承担责任的，债权人可据此要求其承担清偿责任。
四、注意事项与风险提示
- 合法合规：公司注销时往来款的处理必须合法合规，避免违反税法、公司法等相关法律法规。
- 证据保留：在处理往来款时，应保留好相关证据（如合同、发票、催收记录等），以备不时之需。
- 税务风险：往来款的处理结果会影响企业所得税，需按税法规定进行税务申报和缴纳。若处理不当，可能面临税务处罚。
- 法律责任：股东、发起人、清算组成员等在公司注销过程中若存在违法行为，可能需承担相应法律责任。
综上所述，公司注销时股东往来款的处理是一个复杂而关键的过程。建议您在处理前咨询专业律师或会计师的意见，确保合法合规地完成清算工作。